硫酸铜水溶液有强力的杀菌作用，可以用于杀灭真菌。与石灰水混合后生成波尔多液，用于控制柠檬、葡萄、苹果等作物上的真菌，配制波尔多液，硫酸铜和生石灰（最好是块状新鲜石灰）比例一般是1：1或1:2不等，水的用量亦由不同作物、不同病害以及季节气温等因素来决定。配制时最好用“两液法”，即先将硫酸铜和生石灰分别跟所需半量水混合，然后同时倒入另一容器中，不断搅拌，便得天蓝色的胶状液。波尔多液要现配现用，因放置过久，胶状离子会逐渐变大下沉而降低药效。稀溶液用于水族馆中灭菌以及去除蜗牛。

       农业上主要用于防治果树、麦芽、马铃薯、水稻等多种病害，效果良好，但对锈病、白粉病作用差。同时，对植物产生药害同时仅对铜离子药害忍耐力强的作物上或休眠期的果树上使用。是一种预防性杀菌剂，需在病发前使用。

也可用于稻田、池塘除藻。也是一种微量元素肥料，能提高叶绿素的稳定性，预防叶绿素不至于过早地破坏，促进作物的吸收，作物缺铜时失绿，果树缺铜时，果实小，果肉变硬，严重时果树死亡。对铜敏感的作物是禾谷类作物如小麦、大麦、燕麦等，主要用于种子处理和根外追肥。

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