脂质组学

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2021-07-12 15:02

苏州帕诺米克生物科技有限公司

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产品属性
提供商Bionovogene
服务名称脂质组学
产品说明

脂质组学(lipidomics)作为最重要的代谢组学分支之一,是最近几年研究的热点。脂质是生物体内重要的一大类化合物,它们在结构上有很大的差别,但具有相同的特点,即:不溶于水、而溶于Ether、氯仿和丙_酮等非极性有机溶剂中。





研究流程




应用领域




产品优势




使用 LipidSearch 数据库,收录超过 8 大类、300 种亚类、170 万种脂质分子的 MS2&MS3 数据库;




14 种同位素标记脂质,可同时半定量上千种脂质。


样本要求

● 动物组织 ≥ 0.2g
● 植物组织 ≥ 2g
● 尿液 ≥ 0.25ml
● 建议重复:6 个以上
● 粪便 ≥ 0.3g
● 血清、血浆 ≥ 0.3ml
● 唾液 ≥ 1ml
● 样本类型:动物组织、细胞、血液等
● 土壤 ≥ 10g
● 微生物 ≥ 0.12g
● 细胞 ≥ 107
● 液体 / 固体样品,干冰邮寄;大块需要切成 1cm3 块状



分析结果


脂质分类饼图


差异脂质关联和弦图


差异脂质热图


差异脂质韦恩图


差异脂质关联热图



树状图分析



案例分析

【项目文章】CircACC1 调节代谢应激下 AMPK 复合体的组装和激活
CircACC1 regulates assembly and activation of AMPK complex under metabolic stress
期刊:Cell Metabolism 影响因子:21.567
发表时间:2019年7月 发表单位:中国科学院

研究背景
细胞代谢受其所在微环境的影响。AMPK(AMP 活化蛋白激酶)是重要的细胞能量感受器,在细胞能量不足时被激活,进而影响细胞的脂肪酸氧化、糖酵解、脂降解等代谢活动。代谢异常是肿瘤细胞的重要特征之一。由于 AMPK 在细胞代谢中的关键地位,活性受到严格调控,被视为肿瘤治疗的潜在靶点。环状 RNA 是非编码RNA 领域最前沿的研究热点,这类特殊的非编码 RNA 具有组织特异性,在多种疾病生理中发挥着重要的调控作用,但环状 RNA 是否参与 AMPK 的调控尚未清楚。

研究设计和结果
CircACC1 通过与调节的 β 和 γ 亚基形成三元复合物来稳定和促进 AMPK 全酶的活性。细胞水平的 CircACC1调节 β- 脂肪酸氧化和糖酵解,导致细胞脂质储存变化。在异种肿瘤移植模型中,沉默或增强 CircACC1 的表达分别导致生长抑制和增强。此外,结直肠癌组织中 AMPK 活性的增加通常与 CircACC1 表达的增加有关。

图 1 技术路线


图 2 CircACC1 促进糖酵解与脂肪酸氧化

结论
CircACC1 是一种诱导 AMPK 活化的方法,可在癌细胞代谢重编程过程中利用 CircACC1。

参考文献
Li et al., CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress, Cell Metabolism (2019), http://doi.org/10.1016/j.cmet.2019.05.009