宏蛋白组学是应用蛋白组学技术对微生物群落进行研究的一项新技术,在特定时间对微生物群落的所有蛋白组的组成进行大规模的鉴定。所研究种类非常多样化,比如活性淤泥中的微生物,海洋微生物,土壤中的微生物,发酵食品中的微生物,肠道微生物,粪便、黏膜腔等。 宏蛋白质组分析的基础来自于宏基因组测序的精确结果,其数据库来源主要通过两种手段:通过16s测序得到大体物种组成后在公共数据库中提取相应物种序列数据库进行整合;通过全基因组/转录组测序等手段深度测序样品中的DNA/转录组信息。 技术优势 ▶可获得样品中不同物种来源的全部蛋白质信息; ▶可进行样品中微生物群落的组成和功能分析,揭示微生物与环境之间的相互关系。 应用领域 ▶生物医药:肠道菌群与重大疾病关系研究; ▶微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等; ▶临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,精准医疗等。 实验流程 数据分析 参考文献 1. Enteric dysbiosis is associated with sepsis in patients. FASEB J. 2019. 宏蛋白质组学_粪便_脓毒症与肠道微生态的关联研究 2. Integrated Meta-omics Approaches To Understand the Microbiome of Spontaneous Fermentation of Traditional Chinese Pu-erh Tea. APPL ENVIRON MICROB. 2019. 宏蛋白质组学_茶叶_普洱茶自然发酵过程中微生物组的变化研究 3. An integrated metagenomic/metaproteomic investigation of microbiota in dajiang-meju, a traditional fermented soybean product in Northeast China. FOOD RES INT. 2018. 宏蛋白质组学_黄豆饼_黄豆饼中微生物组的组成研究