Cre-Loxp系统
Cre（Cyclization Recombination Enzyme）是由大肠杆菌噬菌体P1编码的Cre基因编码，343个氨基酸组成的38 kd的蛋白质。Cre不仅具有催化活性，而且与限制酶相似，能够特异性识别loxP位点。
LoxP（locus of X-overP1）位点长为34 bp，包括两个13 bp的反向重复序列和一个8 bp的间隔区域。其中，反向重复序列是Cre重组酶的特异识别位点，而间隔区域决定了loxP位点的方向。

Cre-loxp重组系统诱导基因重组的方式
Cre-loxP是一种位点特异的基因重组技术，被广泛应用于特异位点的基因敲除、基因插入、基因翻转和基因易位。Cre重组酶识别特异的DNA 序列，即loxP位点，使两个loxP位点间发生基因重组，重组的结果取决于两个loxP位点的方向。
主要存在几下几种重组方式：
①两个loxP位点位于同一条DNA链上且方向相同，Cre重组酶敲除loxP间的序列；
②两个loxP位点位于同一条DNA链上且方向相反，Cre重组酶诱导loxP间的序列翻转；
③两个loxP位点位于不同的DNA链或染色体上，Cre重组酶诱导两条DNA链发生交换或染色体易位；
④四个loxP位点分别位于两条DNA链或染色体上，Cre重组酶诱导loxP间的序列互换。

Cre-loxp重组系统的优势
①时空特异性，特定启动子或调控基因；
②高效性，不受靶基因大小和位置的影响；
③准确性，动物模型中未见非特异重组；
④快速性，受精卵分裂前。

Cre-loxp重组系统的应用
应用Cre-loxP重组系统较为常见的形式是两种转基因动物的杂交。一般的策略为：
①利用原核注射的方法获得转基因“Cre小鼠”，一般利用特定启动子控制此小鼠的Cre重组酶的表达；
②通过置换型载体的同源重组，在胚胎干细胞中向靶位点引入选择标记基因，并在其两侧引入两个loxP位点，要求两条同源染色体都带有loxP位点，且不能干扰靶基因的转录。将此胚胎干细胞注入假孕母鼠中，发育成“floxed小鼠”；
③“Cre小鼠”与“floxed小鼠”交配，产生的后代体内，Cre重组酶会与loxP位点发生作用，导致基因重组。

病毒依赖的Cre-loxp系统
通过病毒引入Cre或loxP元件，结合转基因鼠是最常用的方式。相比于Cre-loxp转基因动物杂交，病毒依赖的基因重组有以下优点：
①更强的区域特异性：由于病毒可以通过局部注射的方式保证区域特异性感染，再加上驱动Cre基因的特异性启动子，能够实现更强的区域和细胞特异性；
②费用更低：购买转基因动物的费用一般是比较昂贵的，而且转基因动物的饲养、基因型鉴定都需要消耗人力、物力，而病毒的制备、保存和注射所需的费用相对来说较少；
③更短的实验周期：一般AAV的表达时间是3-4周，而转基因小鼠的交配、筛选过程耗时长，因此采用注射病毒到转基因小鼠体内的方式，可以大量缩短实验周期。

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