GRSAM-12 自然选择分析: 正向选择(高通量测序数据分析服务)

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2021-07-12 20:22

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GRSAM-12:自然选择分析: 正向选择

本项模块可分析正向选择位点, 依据全基因组测序SNP标记,计算每基因位点样本之间的SNP相关性(图a),筛选出显著性P值的位点,即与样本表型(phenotype)相关的点突变。为了明确正向选择基因,分析计算dN/dS。 当dN/dS>1属于正向选择;当dN/dS<1属于清除选择(purifying selection)。最后,分析定位的正向选择基因功能富集程度。




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全基因组重测序

全基因组重测序是最全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构,包括点突变SNP/短插入缺失(indel),基因组重排导致的结构变异(SNV),拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH),重复区段(SD),以及重组热点区域(Recombination Hot spots)等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台,凭借多年稳定信息学研究分析经验,惠研生物(BioGenius)可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状(QTL)分析;并可整合多方面基因组学数据做关联分析,包括转录组学数据,表观组数据等,可配合比较基因组学,群体遗传学分析技术,进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。

全基因组适用于:

  • 基于家系遗传病研究;
  • 复杂疾病研究;
  • 基因组进化,
  • 种群体遗传学与性状连锁等研究。




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  • 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计 完成近万个样本的测序与分析服务
  • 累计协助客户发表权威SCI论文总IF超过 160分
  • 512核心CPU,1T内存 满足大规模并行的,敏捷的数据分析服务;
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