MeRIP-seq

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2021-07-15 18:37

上海嘉因生物科技有限公司

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上海嘉因生物科技有限公司
刘盼盼
021-61539657
liupp@rainbow-genome.com
产品属性
服务名称MeRIP-seq技术服务
提供商上海嘉因生物科技有限公司
产品说明
一、产品概述
1. MeRIP-seq概述
m6AN6-methyladenosineRNA腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰,是真核生物mRNA
最常见的一种转录后修饰。
m6A修饰在肥胖、癌症、突触信号传递、精子发育、卵子发生、干细
胞分化、减数分裂、昼夜节律等生物学过程发挥重要作用。
m6A修饰过程中有三大类酶发挥重要
作用,分别是
WritersErasersReaders识别甲基化酶包括YTH结构域蛋白、hnRNP以及eIF等。
m6A残基分布在mRNA5UTR3UTR。主要影响mRNA的可变剪切、调节mRNA的翻译以及影响
mRNA的表达和降解。m6A-seq是基于免疫共沉淀的原理结合测序在全转录组水平上定位m6A修饰。


2. 实验流程
2.1 提取Total RNA并用Oligo-dT磁珠富集mRNA
2.2 通过超声破碎或化学试剂将mRNA进行片段化。
2.3取片段化的mRNA一部分作为input进行测序;另一部分用带有磁珠的m6A抗体
免疫沉淀具有m6A修饰的mRNA片段。

2.4 将带磁珠的抗体洗脱掉,留下m6A修饰的mRNA片段,随机引物构建cDNA文库,
加接头进行测序。