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上海嘉因生物科技有限公司
MeRIP-seq
MeRIP-seq
价 格:
询价
最新更新日期:
2021-07-15 18:37
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上海嘉因生物科技有限公司
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公司:
上海嘉因生物科技有限公司
联系人:
刘盼盼
联系电话:
021-61539657
联系邮箱:
liupp@rainbow-genome.com
QQ:
2319724828
产品属性
服务名称
MeRIP-seq技术服务
提供商
上海嘉因生物科技有限公司
产品说明
一、产品概述
1. MeRIP-seq概述
m6A
(
N6-methyladenosine
)
是
RNA
腺嘌呤第
6
位氮原子上的甲基化修饰,是真核生物
mRNA
上
最常见的一种转录后修饰。
m6A
修饰在肥胖、癌症、突触信号传递、精子发育、卵子发生、干细
胞分化、减数分裂、昼夜节律等生物学过程发挥重要作用。
m6A
修饰过程中有三大类酶发挥重要
作用,分别是
Writers
、
Erasers
和
Readers
。
识别甲基化酶包括
YTH
结构域蛋白、
hnRNP
以及
eIF
等。
m6A
残基分布在
mRNA
的
5
′
UTR
和
3
′
UTR
。主要影响
mRNA
的可变剪切、调节
mRNA
的翻译以及影响
mRNA
的表达和降解。
m6A-seq
是基于免疫共沉淀的原理结合测序在全转录组水平上定位
m6A
修饰。
2. 实验流程
2
.1
提取
Total RNA
并用
Oligo-dT
磁珠富集
mRNA
。
2.2
通过超声破碎或化学试剂将
mRNA
进行片段化。
2.3
取片段化的
mRNA
一部分作为
input
进行测序;另一部分用带有磁珠的
m6A
抗体
免疫沉淀具有
m6A
修饰的
mRNA
片段。
2.4
将带磁珠的抗体洗脱掉,留下
m6A
修饰的
mRNA
片段,随机引物构建
cDNA
文库,
加接头进行测序。
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