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宏基因组测序

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最新更新日期：2021-07-15 19:09

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北京诺赛基因组研究中心有限公司

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公司：北京诺赛基因组研究中心有限公司

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产品属性

服务名称

生物信息学服务

提供商	北京诺赛基因组研究中心有限公司

产品说明

技术简介：
宏基因组学研究不要求对每个微生物进行分离纯化培养，而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过宏基因组测序，能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系，极大地扩展了微生物学研究范围。环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rDNA高变区/ITS 的PCR扩增产物进行高通量测序，分析该环境下微生物群落的多样性和分布规律。

生物信息分析：
1．序列质量控制。
2. 组装序列：
a) 对组装后的contig进行基因预测。
b) 对contig进行序列映射，以得到基因的丰度。
c) 对基因进行注释。
d) 进行组间比较，找到差异基因或基因关联群所对应的基因家族、代谢途径、物种分类等等。
3. 不组装，直接对序列进行注释，进行组间比较。

技术优势：
1、适用范围广：很多自然界中的微生物并不能在实验室条件下进行培养，因此，无需进行分离培养而扩展了微生物研究范围。
2、真实性高：该方法对环境中微生物群落的多样性、功能基因等宏观特征进行了研究，更能有效、准确的反应出微生物的真实状态。

送样要求：

样品	要求
DNA	≥5ug
浓度	≥50ng/ul
纯度	OD_260/280=1.8~2.0；无蛋白及RNA污染

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