IEF 分离蛋白是基于蛋白分子的净电荷而不是分子量。IEF 凝胶由两性电解质载体铺制而成，从而在凝胶中产生 pH 梯度。蛋白迁移到它们的等电点（pI）的pH 时，净电荷为零。IEF 板式凝胶不含变性剂，可以在自然条件下进行单向分离。
