长链非编码RNA(lncRNA)建库测序服务

¥11000
2021-07-23 04:53

北京诺赛基因组研究中心有限公司

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北京诺赛基因组研究中心有限公司
诺赛基因
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产品属性
服务名称新一代高通量测序及生物信息学服务
提供商北京诺赛基因组研究中心有限公司
产品说明
长链非编码RNALncRNA)测序分析
技术简介:长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类长度大于200 nt且无或少有蛋白编码能力的复杂的RNA,广泛存在于各种生物体内。以RNA形式在表观遗传学,转录及转录后等多种水平调控基因表达,在疾病的病理生理过程中起着重要的调节作用。lncRNA测序服务,一次性获得样本中的mRNA和lncRNAs信息,为全面地、深入地研究lncRNAs的功能提供了全新的工具。
项目流程:
生物信息分析:


有参考序列的的长链非编码RNA(lncRNA)测序信息分析
基础分析:
  1. 原始数据质控;
  2. LncRNA的鉴定;
  3. LncRNA表达水平分析;
  4. 差异LncRNA分析;
  5. 差异LncRNA靶基因预测;
  6. 差异LncRNA靶基因的GO分析;
  7. 差异LncRNA靶基因的pathway分析;
  8. 聚类分析。

高级分析:
  1. 预测新的LncRNA;
  2. 新的LncRNA的特征分析;
  3. 新的LncRNA靶基因预测;
  4. 新的LncRNA编码潜能预测;
  5. 新的LncRNA功能注释。


送样要求:
样本类型:RNA样本
样本量(一次):植物、真菌:≥20 ug;动物及原核生物:≥10 ug
样本浓度:植物、真菌:≥250ng/ul;人、大鼠、小鼠:≥65 ng/ul
其它类型动物:≥150 ng/ul;原核生物:≥65 ng/ul
样品纯度:真核:OD260/280=1.8~2.2;OD260/230≥2.0
RIN≥7.0(动物),RIN≥6.5(植物),28S/18S≥1.0;
昆虫样本无此指标
原核:OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.8
RIN≥6.0;23S/16S≥1.0;
技术优势:
  • 通过高通量测序技术,可获得样本中几乎全部的lncRNA序列信息;
  • 不局限于对已知lncRNA的研究,还可对未知的lncRNA进行预测;
  • 除人和鼠外,还可针对其他真核物种进行LncRNA的测序、分析。