代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS,靶向代谢组

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2021-08-10 14:44

西农生(北京)生物技术有限公司

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西农生(北京)生物技术有限公司
周先生
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产品属性
服务名称代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS,靶向代谢组
提供商西农生(北京)生物技术有限公司
产品说明

代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS 

声明:为保护客户的权益与保密协议,在保证实验结果真实有效的前提下,我们对实验的数据进行了适当的变动处理,简化了实验流程及采样数量。请勿转载!责任自负!

使用仪器:液-质联用
UPLC­-----Agilent 1290

Q-TOF LC/MS------Thermo Orbitrap Elite( 分辨率> 240,000 FWHM)或AB Triap 5600+


样品信息:
患病组血清样品vs.对照组血清样品

实验流程
通过UPLC­­­----Q-TOF LC/MS分析,分析患病组和对照组血清样品代谢成分,获得代谢组分的实验数据。利用数学分析方法寻找患病组和对照组中具有差异性的代谢组分,建立未知样本分析模型。

实验步骤:


一、采样
对样本来源进行分组,并记录性别、年龄、病情、治疗等信息;
采集全血,离心后获得血浆/清样本,于-80℃冰箱中保存。

血浆/清样本用提取液沉淀蛋白,并于-20℃下提取化合物1 h;高速离心后取上清液,经真空抽干后复溶于甲醇溶液。


二、仪器分析及数据预处理(信息峰的提取和识别)


图一 人血清样品典型的LC/MS总离子流图(TIC, ESI+,m/z 60–1000.)



三、数据分析


图二:主成分(PCA)得分图:每个点代表一个样本,对照组和患病组样本在CA空间可以明显的分为两组



图三: 偏最小二乘法判别分析3D PLS-DAS-Plot),寻找候选生物标志物,可用疾病诊断和模型识别



四、差异代谢物鉴定

图四:高分辨率MS/MS鉴定,右图是左图(一级质谱结果)单峰的二级质谱结果




另:生物信息学服务内容:后期数据分析及挖掘

 A、疾病识别,诊断模型

 B、系统生物学分析

图五:疾病潜在生物标志物的代谢通路分析,阐释发病机制和生命现象





靶向代谢组:小分子化合物定量分析


运用LC-MS/MS、HPLC、GC-MS对样品中指定小分子化合物进行定性和定量分析。

项目检测内容
靶向组学分析/能够提供定性和相对定量结果,如提供标品可定量靶向脂质PC,PE,CER,SM等(200多种)(加内标需另议)
游离脂肪酸
靶向氨基酸全谱氨基酸(20种)
氨基酸类衍生物及部分极性小分子60多种极性小分子
维生素水溶性和脂溶性维生素
神经递质
乙酰肉碱
花生四烯酸类根据检测指标数量增加
胆汁酸胆汁酸的检测(20)
有机酸GC-MS检测TCA循环有机酸
非靶向代谢组学非靶向全脂质C18正负两种采集模式
传统非靶向代谢组学C18正负两种采集模式(兼顾一部分脂质,和一部分极性分子)
非靶向代谢组学非靶向脂质组学合并
HILIC正采集模式
非靶向代谢组学非靶向脂质组学合并
HILIC正负采集模式
外源性靶向分析药代动力学药时曲线,药物代谢物浓度监测,组织分布
中药血清化学中药成分鉴定以及归属,多组分浓度测定
中药入血成分筛查,组织分布,多组分药代动力学
其他其他靶向组分检测,提供标品也可作方法开发和方法学验证
数据处理:
非靶向数据分析非靶向数据处理靶向质谱数据处理(去噪,提取,匹配,积分),不包括差异比较
非靶向组学差异分析组间代谢组学差异分析,并鉴定差异最为明显的组分
靶向数据分析靶向分析报告(根据实际实验内容)提供定性结果,相对定量的峰面积或组分浓度检测结果
































































1 、AB5500 Qtrap

详见公司网站