CRISPRi(基因抑制/沉默)服务

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2021-08-12 18:59

湖南海星生物科技有限公司

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提供商Cas9X™ | 海星生物
服务名称Cas9X™ | 海星生物
产品说明

Cas9X™ | 海星生物:CRISPRi(基因抑制/沉默)服务

CRISPRi (基因抑制/沉默)系统是用于抑制内源性基因转录的强大工具,当dCas9(没有切割活性的Cas9)被引导到靶基因的转录起始位点TSS(transcription start site)时,dCas9能够物理性阻碍RNA聚合酶的通过,导致基因沉默。同时dCas9融合了一个基因抑制结构域,如KRAB结构域,这样的蛋白称之为dCas9-KRAB,可以进一步提高转录抑制的效率。此外,dCas9也可以融合双抑制结构域KRAB-MeCP2,抑制效果更佳。


由于dCas9-KRAB CRISPRi系统是在DNA水平抑制基因表达,因此适用于多种类型的基因,包括:mRNA、非编码RNA、microRNA、反义转录本、核定位RNA以及聚合酶III 转录本等基因的转录抑制。


CRISPRi显著的转录抑制效果


服务内容:

客户只需要提供要进行敲减的基因和转录本信息,将有海星生物设计gRNA序列,构建病毒载体,病毒包装后转染目的细胞,并根据客户的需求进行筛选出符合敲减水平低gRNA,并提供CRISPRi稳转细胞株的构建和单克隆的扩增筛选的服务。

技术优势:

不改变内源基因组背景、基因抑制效果可筛选、适用更多基因种类。

RNAi vs CRISPRi

研究基因功能最常见的方法是,减少或者阻断基因表达,然后进行表型分析。RNAi和CRISPRi都是常用的基因表达水平敲低的研究工具。

RNAi vs CRISPRi
RNAiCRISPRi
靶向分子成熟RNADNA的转录起始位点
作用位置胞质内细胞核内
脱靶率较低
起作用分子siRNAsgRNA+Cas9


RNA干扰(RNAi)靶向细胞质中成熟的RNA,而CRISPRi则在细胞核内阻止转录的起始,因而敲低效果更为显著。此外RNAi的脱靶效应要远远高于CRISPRi。


CRISPRi的敲低效果显著优于RNAi