血样(尿样)LC-MS代谢组学检测分析方案

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2021-08-16 11:08

浙江天科高新技术发展有限公司

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陈先生
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产品属性
提供商浙江天科高新技术发展有限公司
产品说明
实验目的:
对客户提供的二部分样品分别进行LC-MS检测实验。针对每一部分的样品进行组间两两对比多元统计分析及差异代谢物筛选鉴定。
实验平台:电喷雾四级杆飞行时间质谱

数据分析:
1PCA分析
首先对每一部分所有样本进行主成分分析,从总体上反应各组样本之间的总体代谢差异和组内样本之间的离散程度,用score plot展示PCA分析结果(A)。然后对两组之间的样品进行主成分分析,观察组间样品的分离程度,用score plot展示PCA分析结果(B)。

(2)偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)
为了判别对照组和实验组之间是否具有差异,我们采用 PLS-DA方法对样本进行建模分析。

(3)正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)
为了获得更进一步的认识,我们采用正交偏最小二乘方判别分析(OPLS-DA)过滤与模型分类不相关信号即正交信号,获得OPLS-DA模型,其模型质量参数为,1个主成分,2个正交成分。

4)差异代谢物筛选及其鉴定
我们采用 OPLS-DA模型主成分的VIP(Variable Importance in the Projection)值,并结合t检验(t-test)的p值来寻找差异性表达代谢物。差异性代谢物的定性方法为:根据精确分子量搜索Metlin和HMDB数据库。最终得到差异代谢物信息。

费用及其周期:
费用:
检测费用:650元/样本
分析费用:7500元
周期:
检测实验:3-4周
分析实验:2-3周

送样要求:
用干净的玻璃管收集,血样一般用血清,血浆中的抗凝剂会有干扰,不推荐用血浆做代谢组学;
样品应2年之内较好,年龄性别最好均匀,跨度太大会被质疑的,内标可加,也可不加,用归一化方法处理。