实验目的:
细菌转录组是指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合。应用新一代高通量测序技术进行转录组测序,以高覆盖测序水平对任意细菌的整体转录活动进行检测,比对不同转录本的表达差异,鉴定新基因,sRNA,UTR,operon等。测序长度为2*100bp.
实验流程:
实验平台:Hiseq2000
数据分析:
(1)原始测序Reads质量基本统计
(2)Mapping位置信息(文库为链特异性)
(3)差异表达基因筛选
(4)差异基因功能富集分析
(5)novel sRNA鉴定
(6)UTR预测
(7)Operon预测
费用及其周期:
费用:
检测费用:面谈
周期:
检测实验:45-60工作日
送样要求:
(1)组织样品:提供总量大于100ml,OD为0.5左右的的新鲜样品;采样后应立即用液氮冻存,送样时使用干冰;
(2)RNA/DNA样品:请提供OD260/280介于1.8~2.0之间,浓度>100ng/ul,总量为10ug,并确保RNA无降解,无污染;送样时使用干冰;质检以我方电泳胶图和紫外分析仪定量为准。