STR分析

特点
→ 技术平台：ABI 3130和3730遗传分析系统；基因型分析软件；荧光标记Oligo的化学合成
→ 客户只需提供待测的样本和待测基因STR位点，我们可为您设计实验方案
→ 利用DNA测序仪对片段进行荧光标记，加上分子量内标进行DNA片段分析，可以使STR分型变得异常高效快捷，结果更加精确
→ 如果您研究的位点较多,为了节约您的成本,我们一个泳道可以同时检测三种不同的荧光

原理
短片段重复序列(short tandem repeat, STR)是由2-6个碱基对作为核心单位，串联重复形成的一类DNA序列，由于核心单位重复数目在个体间呈高度变异性并且数量丰富，构成了STR基因座的遗传多态性。它分布于人类整个基因组，平均每15kb就存在一个STR基因座。人类基因组内已发现了七千个以上的STR位点。它具有分布广泛，易于检测，信息量大，有高度多态性并遵循孟德尔共显性遗传等优点。目前STR分析已广泛应用于遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等诸多领域。

服务流程
1) 客户收集标本(血液或组织等标本)，并提取DNA。
2) 确定STR位点，设计实验方案，包括荧光标记的选择，引物的设计、合成和标记，荧光分子量内标的选用等等。
3) 按照所设计的实验方案完成荧光PCR，利用琼脂糖电泳或STR扫板检测结果；若PCR产物特异性不够，将进行优化。
4) PCR产物通过测序仪器电泳检测，获得扩增片段大小的数据
5) 用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等软件对收集到的数据进行处理分析，将产物片段大小、数量多少的信息转化成直观准确的波形图谱，为下一步进行关联分析或连锁分析等遗传分析提供可靠的数据。

客户提供
→ 如果提供基因组DNA：至少提供100 ng DNA样品(针对每个多态性位点，需样品3-5 μl，浓度为30~50 ng/μl)；提供样品类型，DNA溶液浓度和纯度值，以及可能残留的抑制剂成分。样品最好溶解在ddH2O中，如果不是，请写明溶解液成分。
→ 如果提供PCR产物：产物要通过预实验的电泳检测，单一性要好
→ 如果需要设计引物，请提供目的片段序列或者微卫星检测位点，引物设计好后需要客户确认。
我们提供微卫星座位PCR产物全自动检测及分型结果

质量保证
→ 关于样本质量：在对微卫星标记进行基因扫描时，经常会出现某些样本的某些位点无法检出，这通常与样本DNA的质量有关，可以通过提高样本DNA的质量来避免，但尽管如此，对于每一个样本，尤其是进行大量位点全基因组扫描的样本，仍会有一定比例的未检出现象存在。
→ 关于微卫星位点选择：由于只有杂合子的微卫星位点可以提供有效的信息，因此在选取微卫星标记时，一定要选取杂合度高的位点。

更多内容请登陆：cnservice.invitrogen.com