BSA混合池测序

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2021-08-17 08:25

南京极光基因科技有限公司

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丁亦飞
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产品说明

服务简介

BSA的全称bulked segregant analysis,中文名叫集群分离分析法,是指利用目标性状存在极端表型差异的两个亲本构建家系,在子代分离群体中,选取两组表型差异极端的个体分别构建混合池,结合高通量测序技术对混合样本测序,检测与目标性状相关联的位点并对其进行注释,研究控制目标性状的基因及其分子机制。 BSA用于基因定位研究,扩大选择群体(混池大小)和标记密度(例如提升测序深度)后,已经无需用分子标记对整个群体进行基因分型来验证其结果了。

服务详情

实验流程

先提DNA再等量混合。

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样品要求

一般每个子代池混合的子代个体数为>=20个个体。测序深度的建议策略为:亲本10x左右,每个混合池为20x左右,

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交付结果

1, 原始序列数据

2 ,测序数据质量评估

3, 比对统计

4, SNP和InDel检测及注释

5, 子代SNP频率计算

6, 子代SNP频率差异分布 :计算△(SNP-index)

7, 基于SNP标记的目标性状区域定位

8, 其他标记的分析。

个性化的需求可根据具体物种及分析需求讨论方案及报价。