遗传图谱产品概述
遗传图谱(genetic map),又叫连锁图谱(linkage map),是某一物种的染色体图谱,显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置,而不是在每条染色体上特殊的物理位置。是由遗传重组测验结果推算出来的、在一条染色体上可以发生的突变座位的直线排列(基因位点的排列)图。利用全基因组重测序技术对已有参考基因组序列的物种进行个体或群体的全基因组测序,再利用生物信息学方法,检测SNP并计算多态性标记间的遗传连锁距离,来绘制高密度的遗传图谱。遗传图谱能够进行遗传进化分析及重要性状候选基因预测,对物种的分子育种研究具有重大指导意义。
应用领域
1、QTL定位
2、辅助基因组组装和比较基因组学研究
适用范围:
1、适用于所有作图群体(F1、F2、BC1;RILs、DH等)
2、群体大小在100个以上
测序策略
亲本:测序深度10-30X/个体;子代:测序深度4-5X/个体
样本要求
样本类型:无降解或轻微降解,无污染的基因组DNA;
DNA样品量: ≥ 2 μg /单次反应;
样本浓度: ≥ 30 ng/µl;
样本纯度:OD260/280=1.8~2.0;
样本寄送
采用干冰寄送样本。
技术流程
常见问题
Q 遗传图谱构建如何选材?
1、有参考基因组序列的物种(二倍体、四倍体、六倍体物种均可);
2、具有重要农艺性状个体构建的遗传群体(临时群体:F1、F2;永久群体:RIL、DH、NIL 等);
3、后代群体样本数在200以上时,可构建精细遗传图谱。
Q 植物遗传图谱的构建是怎样的?
1、亲本选择差异大,子代可稳定遗传的
2、亲本的标记及差异选择
3、作图群体构建以及分子标记检测
4、连锁分析:两点测验、三点测验(软件:MAPMAKER)
5、遗传标记的染色体定位