BSA性状定位
BSA性状定位（Bulked Segregant Analysis，BSA。集群分离分析）是指针对研究的目标性状，选择表型极端差异的亲本构建家系。利用混池分组分析法，对该家系目标性状表型极端的子代混合成两个样本池进行测序，同时对亲本进行测序，利用高性能计算平台和生物信息学方法，计算影响性状的候选区域以及相应的突变位置和突变类型，实现对目标性状的快速定位，加速作物育种改良。
应用领域
1、QTL-seq定位数量性状位点
2、MutMap定位诱变位点和质量性状
适用范围：
1、单倍体、二倍体或多倍体物种（有参考基因组序列）
2、家系群体（F2、RILs、DH等家系群体）
测序策略
亲本：10X/个，子代：20X/池
样本要求
样本类型：genomeDNA 样品；无降解或轻微降解；无污染;
DNA样品量：≥ 1.4 μg，单次;
样本浓度： ≥ 30 ng/µl;
样本纯度：OD260/280=1.8~2.0;
技术流程

常见问题
Q BSA性状定位的生信分析内容是什么以及其可解决什么问题？
基于比对分析发现SNP、InDel标记，随后根据标记进行差异分析，以获取与目标性状相关的基因。如下表

分析内容	解决问题
与参考基因组比对	比对率和覆盖度分析
SNP、InDel检测及注释	开发SNP、InDel标记
子代SNP、InDel频率差异分析	寻找有差异的SNP、InDel位点
目标性状区域定位	找到与目标性状关联的区域
候选基因提取和功能注释	获得候选基因及基因功能

Q BSA性状定位的后期验证怎么进行？
如果检测碱基变化，PCR扩增出目标区域后，用一代测序即可。如果要进行生物功能的验证，要看客户那边具体的实验设计（基因敲除/回补）。