RACE技术服务

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2021-08-18 15:35

杭州沃森生物技术有限公司

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杭州沃森生物技术有限公司
沈小姐
13732202380 4001580780
service@ws-bio.com
产品属性
服务名称RACE技术服务
提供商杭州沃森生物
产品说明
RACE全长克隆技术服务

服务背景
RACE(rapid-amplification of cDNA ends),即cDNA末端快速克隆技术。该技术是基于PCR技术基础上,先由RT-PCR从RNA中获取cDNA片段,根据已知的一段cDNA片段设计引物,利用PCR向两端延伸扩增从而获得完整的3'端或5'端序列,是一种从低丰度的转录本中快速扩增cDNA的5'和3’末端的有效方法。
相比于其他获得新基因的方法,RACE原理简单、无需建立文库、快速廉价,被越来越多科研工作者采用。但在实际实验操作过程中,受多方面因素(比如RNA样品的提取、酶反应的质量、扩增效率的高低)都会直接影响最终结果。而本公司具有多年RACE经验,总结出了一系列的实验技巧,可以高灵敏度、高特异性地扩增稀有RNA样品或低丰度基因,获得目的基因的全长cDNA序列。

实验原理

3'末端RACE
利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以连有SMART寡核苷酸序列通用接头引物的Oligo(dT)30MN作为锁定引物反转录合成标准第一链cDNA。然后用一个基因特异引物(GSP)作为上游引物,用一个含有部分接头序列的通用引物(UPM)作为下游引物,以cDNA第一链为模板,进行PCR循环,把目的基因3' 末端的DNA片段扩增出来。

5'末端RACE
利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以连有SMART寡核苷酸序列通用接头引物的Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV合成标准第一链cDNA。
利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5’末端时自动加上3-5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oligo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMART序列为模板继续延伸而连上通用接头。然后用一个含有部分接头序列的通用引物(UPM)作为上游引物,用一个基因特异引物(GSP)作为下游引物,以cDNA第一链为模板,进行PCR循环,把目的基因5' 末端的DNA片段扩增出来。


实验流程:
1、总RNA提取以及cDNA反转录
2、根据已知序列设计引物,以cDNA模板进行扩增,验证序列正确性
3、RACE 扩增,并测序,使用锚定PCR(AnchoredPCR)与巢式PCR(Nested PCR)相结合的方法,分别进行3'末端和5'末端RACE并对其产物进行测序
4、根据测序结果拼接目的基因全长cDNA序列
5、将RACE产物进行TA克隆用于后续研究(可根据客户要求自行选择)

服务优势
采用进口试剂,确保实验准确性
较同类产品方法更快速,便捷
丰富的项目经验,超过500例的成功案例
提供全套的后续生物信息学分析服务(可根据客户要求提供个性化分析服务)

服务流程
1、确认客户提供的序列信息
2、评估RACE实验可行性
3、确认样本信息
4、根据客户提供的信息设计好实验方案,销售做出报价合同
4、客户确定无误后签订《沃森生物-RACE检测服务合同》,并签字(或盖章)
5、支付预付款,服务正式启动
6、根据合同实验方案开展实验
8、实验结束后,发送初步实验报告
9、支付实验尾款
10、提供详细实验报告,完成实验项目

材料提交说明
实验样品
1、组织或者细胞:提供尽可能多的新鲜组织或细胞样品(包括3个技术重复),组织样品不少于200 mg,细胞至少107
2、RNA样品:3’ RACE:Total RNA>15μg;5’ RACE:Total RNA>25μg(注:OD260/OD280在1.9-2.1之间,完整性好)

序列信息:
1、大于200bp的已知序列(请注明已知序列的5’ 端及3’ 端):如果已知序列比较短,建议先进行3’ RACE再进行5’ RACE,以提高实验的成功率
2、实验数据和参考文献:这将会帮助我们更好地理解您的实验背景,有利于实验的顺利进行

结果交付
实验结题报告:包括实验步骤,引物信息,实验过程 PCR产物照片,全长序列拼接结果;
测序原始数据:测序彩色波形图、碱基序列图;
实验产物:引物、PCR产物、测序用质粒(限产生克隆测序的情况)。

结果展示

ORF序列图 多序列比对图

进化树

二级结构预测图 蛋白三级结构预测图

常见问题解答
1、超长片段RACE时要注意什么?
以我们的经验来看,有几下几点建议:
(1) 每一轮PCR都需要做个梯度找出最佳退火温度;
(2) 检测RNA是否降解,只有确认没有或只有轻微降解后面的实验才有意义;
(3) 用于第二轮巢式或半巢式PCR模板的第一轮产物应该以不同倍数稀释;
(4) 扩增较长片段时应该适当延长变性时间;
(5) GSP引物设计也不容忽视,需要保证较好的特异性;
(6) 使用LA Taq酶,并配以热启动。

2、5’ RACE扩增的电泳结果为什么出现多种条带?
原因可能是:
扩增的基因为多基因家族的成员;
已知序列信息有限,导致PCR扩增特异性差;
mRNA 5′端剪切、拼接方式不同。

3、3’ RACE PCR扩增产物经电泳分析后,有时为什么出现多条带是什么原因?
原因可能是:
序列信息不清楚导致了非特异性扩增;
扩增的基因为多基因家族的成员;
mRNA不同的拼接方式造成的。

参考报价
(实际价格以咨询结果为准)

RACE实验技术服务(报价单)

服务项目

价格

周期(工作日)

已知序列验证(800bp以内)

1000元/基因

超过800bp,2元/bp

15-20

5-RACE实验(500 bp以内)

3500元/基因

超过500 bp,2.5元/bp

16-22

3-RACE实验(800 bp以内)

2500元/基因

超过800 bp,2元/bp

15-20

生物信息学分析

2000元/基因

10

基础总价

9000元/基因

注:如果提供的基因富含高GC含量(大于65%),则5-RACE,3-RACE分别加收2000元


服务电话: 400-1580-780 0571-86495259
QQ: 2533813840 手机:13732202380

邮箱: service@ws-bio.com 
网址: http://www.ws-bio.com

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