背景简介：iTRAQ和TMT的技术原理一样，所不同的是二者的分子结构有差异。与SILAC相比（标记蛋白质），iTRAQ和TMT是对肽段进行标记的。依据iTRAQ/TMT标签的质量数差异，通过MS实现对多组样品中的蛋白质进行相对定量：

SILAC是通过MS( MSl)对蛋白质进行定量，而iTRAQ/TMT是通过二级MS( MS/MS．MS2)进行定量的；

iTRAQ/TMT兼容性好，并且能同时分析多达8-10组的样品，分析通量高。

试验流程

1、分别提取蛋白质并定量；

2、Trypsin分别对蛋白进行酶解，提取肽段；

3、用不同质量数的iTRAQ/TMT标签分别对肽段样品进行标记：

4、标记完成后，混合样品，用SCX进行组分分离（15-20组分）；

5、对每个组分进行LC-MS分析：

6、蛋白质鉴定与定量分析，筛选差异表达的蛋白；

7、生物学实验验证（Western blot，EUSA等）。