CSAM-06:ChIP-Seq 转录因子结合位点的基序分析

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2021-09-08 10:29

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CSAM-06:ChIP-Seq 转录因子结合位点的基序分析


为了解蛋白结合DNA位置序列(例如转录因子DNA结合位点,称为TFBS)的特异性,本方案将对蛋白因子的强结合峰值上下游100bp区间内序列进行从头探测(Motif识别)。对于调控DNA转录的蛋白因子而言,每个转录因子可能会发现一组不同的结合序列motif;通过不同转录因子的motif分析,可能会发现转录因子共调控的TFBS特征。如果蛋白结合序列来自DNaseI-Seq数据与ChIP-Seq数据相结合的分析结果,本身就提供了更可靠的蛋白结合位点的序列结构。

更多详情:http://www.biogenius.cn/htm/products/chipseq/analysis/2014/1129/367.html

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