为保证PCR结果的准确性，要预防非特异性PCR扩增和污染。常用的措施是使用UNG酶(Uracil-N-Glycosylase)和Taq酶热启动。UNG酶的作用原理是选择性水解断裂含有dU的双链或单链DNA中的尿嘧啶糖苷键，形成的有缺失硷基的DNA链在硷性介质，高温下会进一步水解断裂，从而被消除.UNG酶的最佳活性温度为50℃，95℃灭活。PCR反应最常见, 最重要的污染物是PCR产物,防污染热启动PCR试剂盒以dUTP取代dTTP，所以PCR产物都是含有dU的DNA链。在PCR开始前增加50℃的保温步骤，UNG酶即可将反应体系中已有的U-DNA污染物中的尿嘧啶硷基降解，并在随后变性这步的条件下DNA链断裂,消除由于污染DNA产生的扩增，从而保证扩增结果的特异性，准确性。同时UNG酶被灭活,不会再降解新扩增的产物U-DNA。

高品质的UNG酶可以消除高达108的U-DNA产物，和热启动Taq酶一同用于建立含有UNG/dUTP防污染体系的热启动PCR反应系统。