* –星活性比5倍过量酶切(5 units x 1 hour)还强。

100%酶活性的反应条件

1X 缓冲液EcoRI：
50 mM Tris-HCl (pH 7.5, 37°C), 10 mM MgCl₂, 100 mM NaCl, 0.02% Triton X-100, 0.1 mg/ml BSA。
37°C酶切。

保存缓冲液

EcoRI保存在：
10 mM磷酸钾 (pH 7.4, 25°C), 300 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.2 mg/ml BSA, 0.15% Triton X-100和50%��v/v)甘油。

连接和重新酶切

50倍EcoRI过量酶切后，超过95%的酶切产物可以连接和重新酶切。

琼脂糖包埋DNA酶切

至少需要5 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的λ DNA。

低盐、过量酶切、pH>8.0或用Mn²⁺替代Mg²⁺都会导致星活性。

商业化同裂酶

采用REsearch™软件寻找同功酶。

双酶切

采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。

兼容性末端

XapI, MunI, TasI。

甲基化影响

Dam: 无重叠 – 不影响。
Dcm: 无重叠 – 不影响。
CpG: 可能重叠 – 部分影响。
EcoKI: 无重叠 – 不影响。
EcoBI: 可能重叠 – 不影响。