RNA pull-down/检测RNA与其结合蛋白相互作用

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2021-06-04 13:32

湖南普拉特泽生物科技有限公司

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赵经理
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产品属性
提供商真实实验商-普拉特泽生物
服务名称RNA pull-down/检测RNA与其结合蛋白相互作用
产品说明

应用简介
RNA分子能够与其他生物分子,如蛋白质、DNA和RNA,发生广泛的相互作用,从而以大分子复合物的形式存在于细胞及生物体中,其中,RNA-蛋白质复合物是RNA存在以及发挥功能的重要形式之一。RNA pull-down是检测与RNA(如 miRNA、lncRNA)相互作用的未知蛋白的重要技术之一。


RNA pull-down
首先标记 RNA(如生物素探针标记 RNA),将其与细胞裂解液共同孵育,形成 RNA-蛋白
质复合物,分离复合物得到蛋白质,通过蛋白免疫印迹(western blot)或质谱(mass
spectrometry)检测蛋白。


实验方法
Step1:生物素探针标记RNA的制备
Step2:RNA抽提
Step3:细胞裂解
Step4:磁珠预处理
Step5:RNA与磁珠结合
Step6:RNA 与蛋白相互作用
Step7:蛋白的检测

实验流程






案例展示




Samples were normalized by volume. L = lysate load; FT = flow-through, E = eluate.


技术总结
1. RIP反应体系中的试剂和抗体中均需保证无RNase;
2. 磁珠与带标签的RNA要充分混合,可优化孵育的温度、时间以及RNA的含量等。

结果分析
根据Western blotting检测结果可知带标记的AR 3´-UTR RNA可以特异性的结合HuR蛋白。

交付标准







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