N端修饰, 脂肪酰化, C端修饰, D型氨基酸, 非天然氨基酸,Phe/Tyr衍生系列氨基酸, 长链氨基酸, 荧光标记与猝灭,同位素, 磷酸化, 甲基化, N-甲基化, 环肽, 多肽偶联, 分支多肽,连接臂 蛋白质磷酸化是蛋白质翻译后修饰研究的焦点之一，是生物体系功能转换的“分子开关”，如酶活性调节、信号传导及亚细胞定位等等。磷酸化主要包括四类：
1）O-phosphates (Ser, Thr and Tyr)
2) N-phosphates (Arg, Lys and His)
3) acylphosphates (Asp and Glu)
4) S-phosphates (Cys).
目前研究得比较多的，主要是1）类磷酸化，方法也相对比较成熟.
P1 {pSer}
P2 {pTyr}
P3 {pThr}
P4 {D-pSer}
P5 {D-pTyr}
P6 {D-pThr}
P7 Di-sites in sequence
P8 Tri-sites in sequence
P9 4-sites in sequence
P10 5-sites in sequence
