约惠鹏城:引物设计 CE Design V1.03(适用于ClonExpress 和 Mut Express)

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南京
2021-06-04 13:45

深圳市润博科仪科技有限公司

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产品属性
供应商润博科仪
规格CE Design V1.03(适用于ClonExpress 和 Mut Express)
产品说明
CE Design V1.03(适用于ClonExpress 和 Mut Express)

软件名称:CE Design
软件版本号:V1.03
释放时间:2014-12-25
系统要求:Windows XP 及以上
运行环境:VB 6.0 运行库
使用方式:软件为纯绿色版本,将压缩包内所有文件解压至同一个文件夹下,即可使用

软件功能描述:
CE Design是针对Vazyme同源重组系列产品定向开发的专用引物设计软件适用于使用ClonExpress /Mut Express 全系产品时进行引物设计。软件包含入门克隆引物设计、单片段克隆引物设计、多片段克隆引物设计、单点突变引物设计、双/多点突变引物设计、重组反应DNA 使用量计算、DNA 序列处理、引物Tm 值计算共计八个功能模块。设计人性化、使用便捷,是进行重组克隆实验必备辅助软件。

软件提供以下8 种功能模块: 

1. 入门克隆(ClonExpress Entry)引物设计 
- 依据Tm 值原则,自动计算插入片段特异性扩增引物序列
- 自动在特异性扩增引物5′端添加URS 和DRS 重组序列
- 如选择插入酶切位点,自动在URS/DRS 和特异性扩增序列之间添加酶切位点
- 自动输出插入片段全长引物序列
- 引物Tm 值可直接用于PCR反应中作为退火温度

2. 单片段克隆(ClonExpress II)引物设计
- 根据载体线性化方式自动计算载体末端重组序列
- 依据Tm 值原则,自动计算插入片段特异性扩增引物序列
- 自动在特异性扩增引物5′端添加载体末端重组序列
- 自动输出插入片段全长引物序列
- 如载体线性化方式为PCR 扩增线性化,自动输出载体扩增引物序列
- 引物Tm 值可直接用于PCR 反应中作为退火温度

3. 多片段克隆(ClonExpress MultiS)引物设计
- 根据载体线性化方式自动计算载体末端重组序列
- 根据Tm 值、同源序列GC 含量原则,自动计算插入片段特异性扩增引物序列和片段之间的重组序列
- 自动在特异性扩增引物5′端添加载体末端重组序列和片段之间的重组序列
- 自动输出各个插入片段全长引物序列及载体扩增引物序列
- 如载体线性化方式为PCR 扩增线性化,自动输出载体扩增引物序列
- 引物Tm 值可直接用于PCR 反应中作为退火温度

4. 单点突变(MutExpress II)引物设计
- 根据Tm 值、互补区GC 含量、单点突变引物设计原则,自动计算载体扩增引物序列
- 自动输出载体扩增全长引物序列
- 引物Tm 值可直接用于PCR 反应中作为退火温度

5. 双/多点突变(MutExpress II/MutExpress MultiS)引物设计
- 根据Tm 值、互补区GC 含量、双/多点引物设计原则,自动计算待突变位点的扩增引物序列
- 自动输出待突变位点部分反向互补全长引物序列
- 引物Tm值可直接用于PCR 反应中作为退火温度

6. 重组反应DNA 使用量计算程序
- 根据实验类型、实验要求自动计算重组反应最适DNA 使用量

7. DNA 序列处理工具
- 对输入序列进行反向、互补、反向互补计算

8. 引物Tm 值计算工具
- 采用最近相