Affymetrix miRNA芯片检测

简介

Affymetrix公司于2011年2月底推出了miRNA芯片的升级版本GeneChip miRNA 2.0，这款芯片不仅完全覆盖Sanger miRBase 15.0版本131个物种的所有miRNA成熟体，还包括人的2，334个snoRNA和scaRNA，并针对人、大鼠、小鼠的miRNA前体设计了2,202个探针组。前代miRNA芯片产品将于2011年9月30日停止供应。该芯片仅需约3-5 μg的total RNA就可以出色的完成实验，同时保证了卓越的特异性，是研究miRNA全面而准确的芯片工具。

检测原理

Affymetrix miRNA芯片检测，采用FlashTag Biotin RNA Labeling Kit进行样品标记过程，具有快速，精确，灵敏度高，重复性好的特点。RNA样品采用Poly(A) RNA聚合酶加尾，利用RNA连接酶将带有生物素标记的信号分子与之连接，连接产物和芯片进行杂交反应。可标记多种RNA样品：如total RNA；降解的RNA；低分子量RNA (LMW RNA)。整个标记过程可以在一个小时内完成。标记过程如下所示：

该方法高灵敏度主要归因于Genisphere的3DNA多聚体信号放大技术，该多聚体是由多条DNA交联并结合有生物素的带有许多分枝的生物大分子，每个3DNA分子结合有大约15个生物素，而普通标记物通常只结合一个生物素分子。

技术优势

全面：Affymetrix GeneChip miRNA 2.0一张芯片上覆盖131个物种的miRNA，还包括人的2,334个snoRNA和scaRNA，并针对人、大鼠、小鼠的miRNA前体设计了2,202个探针组进行全面检测；

灵敏：采用专利FlashTag Biotin RNA Labeling Kits，Total RNA最低起始量最低可至100ng(要求纯化后的total RNA达到1μg)；检测线性范围大于1000；对85%的miRNA检测可检测到的1 attomoles；

准确：芯片重复性好，片间和片内相关系数大于0.95；无需进行miRNA扩增，克服了研究miRNA的困难；

质控完善：Affymetrix专业的探针设计和质控，保证杂交特异性。

产品列表

检测物种及miRNA数目

Affymetrix miRNA芯片检测的主要物种及miRNA数目：