牡蛎疱疹病毒 1 型探针法荧光定量PCR 试剂盒

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国产
2022-09-06 11:32

优利科(上海)生命科学有限公司

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优利科(上海)生命科学有限公司
王经理
产品属性
产品说明
牡蛎疱疹病毒 1 型探针法荧光定量PCR 试剂盒

产品及特点
牡蛎疱疹病毒(Ostreid herpesvirus-1,OsHV-1)是引起多种双壳贝类特别是牡蛎大规模死亡的致死性病毒,在世界范围内广泛流行,主要危害牡蛎、扇贝、 菲律宾蛤仔及魁蚶等种类,对贝类养殖业造成重大的损害。本产品就是以探针法荧光定量 PCR 技术为基础开发的专门检测牡蛎疱疹病毒 1 型的试剂盒,它具有下列特点:
  1. 即开即用,用户只需要提供样品 DNA 模板。
  2. 引物和探针经过优化,灵敏性高。
  3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
  4. 特异性高,引物是根据牡蛎疱疹病毒 1 型高度保守区设计,不会跟其他病原DNA 发生交叉反应。
  5. 本产品足够 50 次 20μL 体系的探针法荧光定量 PCR 反应。
  6. 本产品只能用于科研。
运输及保存

低温运输,-20℃保存,保存期限为 12 个月。

自备试剂

样品 DNA。


使用方法

一、稀释标准曲线样品(以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原, 本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的 DNA 片段作为阳性对照。1. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
  1. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
  2. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
  3. 换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
  4. 换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
  5. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。样品 DNA 的制备
  6. 如果有 N 个样品,最好设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 阳性对照的 10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为 NC。
  7. 用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数 DNA 提取试剂盒兼容。

    Probe qPCR 反应(20μL 体系,在样品制备室进行)

  8. 如果做定量分析并且只做 1 次重复,则标记 N+9 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),6 个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1 次重复,则标记 N+4 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),1 个用于 PCR 阳性对照(用第 4 号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
  9. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设 置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好 后最后加)
  10. 成分样品管
    N+2 个
    PCR 阴
    性对照管
    标准曲线
    样品管(2-7 管)
    2×Probe qPCR MagicMix10 μL10 μL各 10 μL
    牡蛎疱疹病毒 1 型 qPCR 探针1 μL1 μL各 1 μL
    牡蛎疱疹病毒 1 型探针法 qPCR
    引物混合液
    2 μL2 μL各 2 μL
    N+2 个待测 DNA 模板7 μL--
    超纯水-7 μL-
    第 7 步所得标准曲线样品稀释液
    (2-7 号)

    -

    -
    各 7 μL(2 号样到 2 号管,3 号样到 3
    号管…)


  1. 盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR:

    过程 温度 时间

    预变性95℃3 min
    PCR 反应
    (40 个循环)
    95℃15sec
    60℃1 min(采集 FAM 通道的荧光
    信号)


四、数据处理
  1. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品RNA 浓度的 log 值,再推算出其浓度。
  2. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等于 40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性,如果小于或等于 35 则为阳性。如果在 35-40 之间,则重复一次。若重复结果 Ct 值
小于 40,扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性,否则为阴性。