| 服务名称 | 人类全基因组测序(Human Whole Genome Sequencing) |
研究内容:
Ø人的全基因组重测序
Ø肿瘤样本的全基因组测序
ØSNPs、Indel、CNV、LOH等基因组结构变异的识别和分析
技术特点:
ØSOLiD4测序系统具有更高的测序精确度和通量
Ø长达10Kb插入片段的mate-pair测序能检测多数的染色体结构变异
Ø可以识别出1-50 bp 的indel
实际应用:
应用最新SOLiD4技术平台完成了多种肿瘤全基因组测序
外显子组序列捕获及高通量测序(Exome Sequencing):
研究内容:
Ø利用芯片捕获外显子区域
Ø高通量的外显子序列测序
技术特点:
Ø每次实验仅需少量样品基因组DNA
Ø探索任何感兴趣区域,利用芯片可对18000个基因和550个miRNA所在区域进行研究
Ø定向靶区域获取一致的测序覆盖率
Ø高通量测序识别单核苷酸多态性(SNPs)及任何大小片段插入或缺失造成的突变
Ø专门设计的肿瘤基因组外显子特异探针,富含promoter区域
Ø独特的建库技术,降低冗余度及PCR扩增偏好与误差
Ø综合NimbleGene Sequcence Capture 2.1M Human Exome Array和Agilent SureSelect Exome Array两种技术的优点
实际应用:
已完成肿瘤基因组全外显子测序,90%以上碱基的序列覆盖度>10倍, 80%以上碱基的序列覆盖度>20倍