可应用于单个或群体细菌、真菌、动植物的全 基因组测序或重测序工作，以助于研究者发现单核苷酸多态性位点 （SNPs）、插入（Insertion）、缺失（Deletion）等变异类型。 生物信息分析内容 1．数据量产出 总碱基数量、Totally mappedreads、Uniquely mapped reads统计，测序深度分析。 2．一致性序列组装与参考基因组序列（Reference genome sequence）的比对分析，利用贝叶斯 统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型，并组装出该个体基因组 的一致序列。 3．SNP检测及在基因组中的分布 提取全基因组中所有多态性位点，结合质量值、测序深度、重复性等因素作进一步的过滤筛选，最终得到可信度高的SNP数据集。并根据参考基因组序列对检测到的变异进行注释。 4．InDel检测及在基因组的分布在进行mapping的过程中，进行容Gap的比对并检测可信的Short InDel。在检测过程中，Gap的长度为1~5个碱基。 5．Structure Variation检测及在基因组中的分布目前能够检测到的结构变异类型主要有：插入、缺失、复制、倒位、易位等。根据测序个体序列与参考基因组序列比对分析结果，检测全基因组水平的结构变异并对检测到的变异进进行注释。
