扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的某一或某几个区，使用Illumina MiSeq将目的区域正反向读通，通过检测目的区域的序列变异和丰度，对环境样本物种分类及丰度，种群结构，系统进化，群落比较等方面信息进行分析的研究方法。

16S rDNA是细菌分类学研究中最常用的“分子钟”，其序列包含9个可变区（Variable region）和10个保守区（constant region）。可变区因细菌而异，且变异程度与细菌的系统发育密切相关。通过检测16S rDNA的序列变异和丰度，可以了解环境样品中群落多样性信息。基于16S rDNA的分析在微生物分类鉴定，微生态研究等方面起到重要作用。

18S rDNA或ITS（Internal Transcribed Spacer）被广泛应用在真菌分类鉴定中。18S rDNA在系统发育研究中较适用于种级以上阶元的分类。ITS属于中度保守的区域，利用它可研究种及种以下的分类阶元。

HiSeq 2000，454FLX+，MiSeq各具有优势，满足不同研究者多方面的研究需求。

技术优势

1. 易操作：环境样品（微生物群落）的最优解决方案，完全摆脱繁杂的菌株分离工作；
2. 更准确：从碱基保守水平测定，真实反映物种情况；
3. 更高效：与传统的研究方法相比，具有通量大、产出数据多。

研究内容

一、标准信息分析

1）数据统计

去除接头污染和低质量的reads

产出数据及质控统计

Paired-end reads拼接为tags

去除引物序列

2）物种组成和丰度

对Unique Tag聚OTU并进行物种注释

物种（或OTU）丰度分析（默认会从门、纲、目、科、属、种比较统计）

3）样品复杂度分析

单个样品复杂度分析(α 多样性分析)

样品间复杂度比较分析（β 多样性分析，样品数≥3）

样品间复杂度差异主要因子分析（主成分分析，样品数≥3）

不同样品物种组成聚类分析（样品数≥3）

4）信息挖掘推荐

不同环境样品信息挖掘推荐

二、定制化分析case by case

可结合客户的需求，协商确定信息分析内容。

更多详细信息请访问

http://www.bgitechsolutions.cn/service-solutions/ngs/metagenomics/amplicon-sequencing/

或拨打咨询热线：400-706-6615

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