全基因组denovo测序即全基因组从头测序，是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序，然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装，获得该物种基因组序列图谱,同时借助比较基因组方法来探索生物的起源和进化。

全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序，并在个体或群体水平进行差异性分析的测序方法。可以全面的挖掘单核苷酸多态性位点（SNP）、插入缺失（InDel）和结构变异（SNV等多态性信息）。全基因组重测序已经成为动植物育种、群体进化、药物研发、疾病研究和临床诊断中最为迅速而有效的方法之一，在全基因组水平上扫描并检测与生物体重要性状相关的突变位点对分子育种研究具有重大的科研价值和产业价值。

1.1 技术路线

1.2 生物信息分析

1、基因组组装

2、基因组注释
·重复序列分析与注释；
·基因预测；
·基因功能注释；
· ncRNA注释。

3、动植物比较基因组学与进化分析
·基因家族分析；
·物种系统发育树构建；
·基因组共线性分析；
·全基因组复制分析。

4、基因组数据库网站的建立

1.3 送样要求

1) 样品总量：≥ 10ug;
2) 样品浓度：≥ 50ng/ul，样品浓度越高越好。 
3) 样品纯度：OD值260/280应在1.8～2.0;
4) 样品质量：基因组完整、无降解。
5) 样品包装：用封口膜密封样品，DNA低温运输（-20℃）

● 参考文献

1、Kim S,et al.Genome sequence of the hot pepper provides insights into the evolution of pungency in Capsicum species. Nat Genet. 2014: 10.1038

2、Wang X,et al.The locust genome provides insight into swarm formation and long-distance flight. Nat Commun.2014;5:2957.

3、Venkatesh B,et al.Elephant shark genome provides unique insights into gnathostome evolution. Nature. 2014;505(7482)