宏基因测序服务介绍 宏基因组学研究不要求对每个微生物进行分离纯化培养，而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过宏基因组测序，能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系，大大地扩展了微生物学研究范围。环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rDNA高变区/ITS 的PCR扩增产物进行高通量测序，分析该环境下微生物群落的多样性和分布规律。

宏基因测序分析项目

标准分析项目

1.去除宿主污染，产出数据及质控统计；

2.组装前，通过K-mer分析评估样品的测序深度；

3.序列组装；

4.基因组结构注释（串联重复序列注释、短回文重复序列注释、可变遗传因子注释、基因编码区域预测、NCBI NR库比对、致病岛预测、前噬菌体预测、毒力因子预测，可选）；

5.基因功能注释（GO功能注释，KEGG通路注释，Swissprot数据库注释、COG功能分类）；

6.比较基因组分析（基因家族分析，系统进化树构建，物种分期时间预测）；

7.生物种类和丰度估计；

8.样本间群落结构比较（多样本）；

9.微生物生物分布与环境关联分析（多样本）。

分析项目：重要结论的获得、聚类分析、主成分分析、通路富集分析、功能富集分析、个性化分析。