本产品是一种在较高温度(65℃以上)时仍然保持活性的核糖核酸内切酶。本制品可以选择性识别并酶切RNA:DNA杂合双链中的RNA的磷酸二酯键,同时杂合双链中的DNA会保持完整。本制品不会降解单链或双链的RNA或DNA。
本产品在65℃以上温度时仍具有很高的酶活性,其在70℃时的半衰期可达几个小时,在高达95℃时的半衰期仍可达30分钟左右。该酶的耐高温特性使得异源双链RNA:DNA杂交分子具有更高的特异性,并在较高温度下更特异性地降解杂合双链中的RNA。Thermostable RNase H具有与常见的E.coli RNase H具有类似的酶学性质,但E.coli RNase H在高于55℃时即失活。
应用效果:A.
本产品与E.coli RNase H的热稳定性比较请参考图1。 
图1.本产品与E.coli RNase H的热稳定性比较。在20μL反应体系中加入图中指定量的Thermostable RNase H或E.coli RNase H,在65℃孵育20min后,Thermostable RNase H和E.coli RNase H分别按照其标准的反应条件(Thermostable RNase H 50℃孵育20min;E.coli RNase H 37℃孵育20min)进行RNA:DNA杂交链的酶切反应,反应完毕后立即冰浴3~5分钟并加入1μL 0.5M EDTA终止反应。取出5μL反应液,加入1μL 6×DNA Loading Buffer,然后进行15%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(冰浴条件下180V电泳45min;之后用红色核酸染料(货号:
YT015)室温染色15min,即可拍照观察结果)。如图所示,E.coli RNase H在65℃时失去活性,而Thermostable RNase H在65℃时仍保持活性。热稳定性比较反应体系(20μL):
● Thermostable RNase H:
50mM Tris-HCl (pH8.3),75mM KCl,3mM MgCl2,10mM DTT,400ng RNA:DNA杂合双链以及不同量的Thermostable RNase H (包括未经热处理和在65℃孵育20min热处理),50℃孵育20min;
● E.coli RNase H:
20mM Tris-HCl (pH7.8),40mM KCl,8mM MgCl2,1mM DTT,400ng RNA:DNA杂合双链以及不同量的E.coli RNase H (包括未经热处理和在65℃孵育20min热处理),37℃孵育20min。
B.
本产品催化降解RNA:DNA杂合双链中的RNA链的效果请参考图2: 
本产品和N公司的同类产品的效果比较图。使用本产品或竞品的Thermostable RNase H,在20μL反应体系中加入图中指定量的本制品或竞品,50℃孵育20min进行反应,反应完毕后立即冰浴3~5分钟并加入1μL 0.5M EDTA以终止反应。取出5μL反应液,加入1μL 6×DNA Loading Buffer,然后进行15%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(冰浴条件下180V电泳45min;之后用红色核酸染料(货号:
YT015)室温染色15min,即可拍照观察结果)。如图所示,本制品与竞品相比,具有类似的催化效果。RNA:DNA杂合双链反应体系(20μL):50mM Tris-HCl (pH8.3),75mM KCl,3mM MgCl
2,10mM DTT,400ng RNA:DNA杂合双链以及不同量的Thermostable RNase H,50℃孵育20min。
产品用途:1.严谨的RNA结构图谱的描绘和位点特异性RNA切割;
2.与oligo (dT)杂交的mRNA的poly (A)尾的酶切去除;
3.cDNA合成后去除mRNA;用于等温扩增实验;
4.用于和特定DNA序列杂交后酶切去除特定的RNA序列,例如rRNA的去除等。
产品组成:| 组分 | 250U | 1000U | 5000U |
| Thermostable RNase H(5U/μL) | 50μL | 200μL | 1mL |
| 10×RNaseH Reaction Buffer | 150μL | 500μL | 2mL |
保存:-20℃,有效期一年。
缓冲体系: 10×RNaseH Reaction Buffer: 500mM Tris-HCl (pH8.3 at 25℃),750mM KCl,30mM MgCl
2,100mM DTT。
酶贮存液: 50mM Tris-HCl (pH7.5),100mM NaCl,1mM DTT,0.1mM EDTA,0.1% Triton X-100,50% (v/v) Glycerol。
产品来源: 大肠杆菌表达的重组蛋白。
活性定义: One unit is defined as the amount of enzyme required to produce 1nmol of ribonucleotides from 40pmol of a fluorescently labeled 25 base pair RNA:DNA hybrid in a total reaction volume of 50μL in 20minutes at 50℃。
质量控制: 纯度大于95%,不含DNA内切酶和外切酶,不含其它核糖核酸酶。
失活抑制: 加入适量蛋白酶K消化或加入5%体积的0.5M EDTA pH8.0。
注意事项:1.本产品的最佳反应温度高于65℃,在95℃时仍具有活性,其在65℃时的活性是在37℃时的3~4倍。
2.本产品在使用说明中建议的反应温度是50℃,在实际实验操作中可以酌情通过提高反应温度提高其酶活性。
3.本产品的反应缓冲液中包含MgCl2,当Thermostable RNase H在高温时应用于RNA/DNA杂交链或者RNA样品时,建议适当限制反应时间和温度,以减少金属介导的单链RNA降解。
使用方法: 1.
RNA/DNA杂合双链的退火。 将单链RNA和DNA等摩尔数混合,推荐的终浓度为20μM,90℃孵育1min,然后通过梯度降温至25℃退火形成RNA:DNA杂交双链。推荐使用我公司的Annealing Buffer for RNA oligos (货号:
YT529),并按照该产品的使用说明进行退火反应。退火后的双链如果不立即用于后续的翻译,推荐在-80℃保存。
2.
反应体系的设置。对于RNA:DNA杂合双链中的RNA链的降解,参考下表在冰浴中配制如下反应体系。
| 成分 | 用量 | 终浓度 |
| DEPC-treated Water | (17-x)μl | - |
| RNA:DNA hybrid | xμl | ≤0.1μg/μL |
| 10×RNase H Reaction Buffer | 2μL | 1× |
| Thermostable RNase H (5U/μL) | 1μL | 0.25U/μL |
| Total Volume | 20μL | - |
注意:
a.由于涉及RNA操作,需要严格按照RNA操作的规范进行,避免RNase污染,相关试剂和耗材需要经过DEPC处理去除RNase或者确保是RNase free的。
b.如果同时进行多个反应,可以把上表中除RNA:DNA杂合双链之外的所有溶液和酶提前混合,然后再分装到各反应管。
c.RNA:DNA杂合双链的用量可以是2μg或者更少。通常上述反应体系中的杂合双链的量不超过2μg,可以确保酶切充分。
3.
酶切反应:50℃孵育20min。 如果发现效果欠佳,可以根据杂合双链的稳定性尝试将反应温度提高至65℃或更高温度(65℃时的酶活性约是50℃时的3倍),也可以考虑适当延长反应时间。对于去除总RNA的复杂RNA体系中的特定RNA的反应体系,酶切反应的温度可以适当摸索,例如适当提高酶切的温度,以确保更高的酶切特异性。
4.
终止反应:反应结束后加入蛋白酶K或1μL 0.5M EDTA pH8.0,终止反应。