基因组功能注释与分析平台介绍
通过生物信息学的方法解读微生物的基因组信息,使人们迅速得获得一个生物的大部分基因功能信息;利用获取的信息与已知的近缘生物基因组进行比较分析,进一步挖掘序列背后的生物学意义,为生物学家提供指导。
功能基因组注释
- 基因预测
- 基因功能注释
- 蛋白质功能分类
- 蛋白质亚细胞定位
- rRNA和tRNA基因预测
功能基因组分析
- Paralog和Ortholog计算
- 代谢通路的构建
- 基因岛和水平转移基因的发现
- 基因组多态性的分析
- 基于同源基因的DN/DS计算的进化分析
- 基于同源基因的预测,利用KEGG数据库的Pathway信息,对微生物的重要代谢通路和关键酶的发现
- 关键酶的进化分析和对主要功能结构域的预测
- 根据分析设计实验对关键酶进行分子水平的改造