本试剂盒是一种快速简单、可用于聚丙烯酰胺凝胶中的核酸检测的试剂盒。该方法检测灵敏度比EB高达200倍,能检测到10ng的DNA条带,常用于检测SSR标记、SNP标记等。
产品组成:| 组分 | 规格 |
| 试剂A-增敏液(10×) | 250mL |
| 试剂B-加速液(10×) | 250mL |
| 试剂C-染色溶液(100×) | 26mL |
| 试剂D-基本显色液(10×) | 250mL |
| 试剂E-显色加速液(500×) | 5mL |
保存:室温,有效期1年,其中试剂C和试剂E需避光保存。
规格说明: 本试剂盒可足够用于25块常规的8×10cm凝胶的染色。
注意事项:1.由于染色非常灵敏,操作时请注意尽量使用高纯度的水,并确保所使用的器皿非常清洁,最好使用洁净的玻璃器皿。操作时必须戴手套,避免皮肤和凝胶直接接触。
2.需自备无水乙醇及MilliQ级纯水。
3.下述使用说明中各种溶液的使用量适用于大小为8×10cm厚度为0.75~1mm的凝胶。
对于更大的凝胶,各种溶液的使用量需按凝胶面积的比例放大,对于更厚的凝胶,作用时间需按照厚度的比例适当延长。
4.本说明书所指的常温温度为20~25℃,操作温度较低时由于溶液的扩散能力下降,各步骤需适当延长时间。
5.基本显色液(10×)在低温环境下可能会出现沉淀,可在37℃水浴中溶解,并充分混匀后使用。
使用方法:A.漂洗步骤:
电泳结束后,凝胶中加入100mL MilliQ级纯水,在摇床上常温摇动2分钟,摇动速度为60~70rpm;重复此步骤1次。
B.染色步骤:
1.染色:
弃水,加入100mL即用型染色液,在摇床上常温摇动5分钟,摇动速度为60~70rpm。
| 即用型染色液配制量 | 100mL |
| 超纯水 | 79mL |
| 试剂A-增敏液(10×) | 10mL |
| 试剂B-加速液(10×) | 10mL |
| 试剂C-染色溶液(100×) | 1mL |
注:即用型染色液配制后需在20分钟内使用。
2.水洗涤:
弃原有溶液,加入100mL MilliQ级纯水或双蒸水,在摇床上室温摇动15~20秒,摇动速度为60~70rpm。
注意:水洗涤的时间不能超过20秒。
C.显色步骤:
弃水,加入100mL显色液,在摇床上室温摇动3~10分钟,直至出现比较理想的预期核酸条带,摇动速度为60~70rpm。
| 显色液配制量 | 100mL |
| 超纯水 | 89.8mL |
| 试剂D-基本显色液(10×) | 10mL |
| 试剂E-显色加速液(500×) | 0.2mL |
D.终止步骤:
弃显色液,加入100mL MilliQ级纯水,在摇床上常温摇动3~5分钟,摇动速度为60~70rpm。
E.保存:
可在MilliQ级纯水中保存;或采用适当的方式制备成干胶。
常见问题:A.背景太深:
1.显色时间过长。通常显色反应会在10分钟内结束,显色反应时间过长会导致背景很深。
2.水的纯度太低。需使用大于16MΩ·cm的高纯度水。
B.核酸条带非常浅:
1.染色后水洗涤时间过长。在染色溶液染色后需严格控制水洗涤的时间,水洗涤的时间不能超过20秒,否则会导致过多的染色离子被洗去,导致检测灵敏度下降。
2.显色加速液(500×)失效。显色加速液(500×)不能低温保存,低温保存会导致加速液失效。
C.凝胶上出现小点或其它非核酸的痕迹:
1.凝胶没有充分被溶液浸没。请注意选择大小合适的容器,并加入足量的各种溶液,同时需保持适当的混匀速度确保凝胶可以被溶液浸没。
2.用于染色的容器没有充分洗涤干净。容器需先用洗涤剂充分洗涤,随后用自来水充分冲洗,最后用高纯度水再洗涤数次。该容器最好能专用于染色,并注意避免各种可能的污染。
3.指纹或其它压痕。请注意戴手套操作,切勿直接接触皮肤。操作时请注意尽量勿挤压、折叠或摩擦凝胶。
4.有金属物质接触凝胶。金属物质例如金属镊子等接触凝胶会出现非特异性痕迹。
实验示例:
记录表格: 实验日期: | | 约25~30分钟 | 标记√ | 起始时间 |
| A.漂洗步骤 | 水漂洗 | 2×2min | | |
| B.染色步骤 | | | | |
| 染色 | 5min | | |
| 水漂洗 | <1min | | |
| C.显色步骤 | 显色 | 3~10min | | |
| D.终止步骤 | 水漂洗 | 5min | | |
| E.保存 | | | | |