本产品是以探针法荧光定量PCR技术为基础开发的专门检测猪托克特诺病毒1型的试剂盒。
背景资料: 细环病毒是近年来发现的一种新型人畜共患DNA病毒,广泛存在于包括人类和家畜在内的多种哺乳动物中。目前我国猪群中TTV的流行病学报道较少。猪细环病毒1型(Torque Teno Sus Virus Type1,TTSuV-1)是新近发现的一种无囊膜的环状DNA病毒,衣壳蛋白是其主要结构蛋白,因此猪托克特诺病毒1型的快速准确鉴定对该病的预防和检疫有着重要作用。
产品特点:1.即开即用,用户只需要提供样品DNA模板。
2.引物和探针经过优化,灵敏性高。
3.提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4.特异性高,引物是根据猪托克特诺病毒1型通用高度保守区设计。
5.本产品足够50次20μL体系的探针法荧光定量PCR反应。
6.本产品只能用于科研。
产品组成:| 组分 | 规格 |
| 2×Probe qPCR MagicMix | 500μL |
| 荧光PCR专用模板稀释液 | 1mL |
| 猪托克特诺病毒1型探针法qPCR引物-探针混合液 | 150μL |
| 猪托克特诺病毒1型qPCR阳性对照(1×107拷贝/μL) | 50μL |
保存:-20℃,有效期一年。
使用方法: 一、稀释PCR阳性对照(以10
1~10
6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)
如果做定性实验,则此步可以跳过。如果做定量实验,则需要稀释阳性对照做标准曲线。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。本产品只提供DNA片段作为阳性对照。
1.标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。
2.用带芯枪头分别加入45μL荧光PCR专用模板稀释液(最好用带芯枪头,下同)。
3.在6号管中加入5μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×106拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
4.换枪头,在5号管中加入5μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×105拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5.换枪头,在4号管中加入5μL 1×105拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×104拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6.重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上用。
二、样品DNA的制备7.如果有N个样品,必须设置N+2个提取,多出的一个是样品制备PC(样品制备阳性对照),一个是样品制备NC(样品制备阴性对照)。可以用10μL阳性对照的10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为样品制备PC。另外用水作为样品制备NC。
8.用自选方法纯化样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容。
三、Probe qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
9.如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第4号管中的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为描述操作步骤,10.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
| 成分 | 样品管 N+2个 | PCR阴性 对照管 | 曲线样品管 (1~6管) |
| 2×Probe qPCR MagicMix | 10μL | 10μL | 各10μL |
| 猪托克特诺病毒1型探针法qPCR引物混合液-探针混合液 | 3μL | 3μL | 各3μL |
| N+2个待测DNA模板 | 7μL | 不加 | 不加 |
| 超纯水 | 不加 | 7μL | 不加 |
| 第6步所得标准曲线样品稀释液(1~6号) | 不加 | 不加 | 各7μL |
11.盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
| 过程 | 温度 | 时间 |
| 预变性 | 95℃ | 5min |
qPCR反应 (40个循环) | 95℃ | 15sec |
| 60℃ | 1min(采集FAM通道的荧光信号) |
四、数据处理12.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。
13.如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于35。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于35则为阳性。如果在35~40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。