帽结构mRNA甲基转移酶 产品官方链接

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百奥莱博
北京
2024-06-20 14:12

北京百奥莱博科技有限公司

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王欣
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北京百奥莱博科技有限公司
产品属性
货号JN3051
规格2500U
产品说明
本产品能在RNA 5′末端紧邻帽结构的第一个核苷酸的2′-O上添加甲基基团,利用S-腺苷甲硫氨酸(SAM)作为甲基供体,使带帽Cap 0甲基化为Cap 1。该酶只能以带7-甲基鸟苷帽结构(m7GpppN)的RNA为底物,不会作用于5′末端为pN、ppN、pppN或GpppN的RNA。带7-甲基鸟苷帽结构(m7GpppN)的RNA可通过我司的mRNA加帽试剂盒(Cap0结构,货号:JN3055)获得。

背景资料:
Cap 0-和Cap 1-mRNA之间的差异在RNA 5'端第一位核苷酸(N1)是否具有2'-O-甲基,在高等真核细胞中,该甲基化是天然加帽过程的一部分,Cap 1结构提高了mRNA的翻译效率。
Cap0结构2'-O-甲基转移酶
Cap0结构2'-O-甲基转移酶
图1.mRNA帽结构2′ -O-甲基转移酶作用机理。mRNA的帽结构是由一个7-甲基鸟苷通过一个5′–5′三磷酸酯桥连接到mRNA链的5′核苷上组成。Cap0结构由相邻的RNA链通过三种酶的依次反应形成。进一步形成cap-1结构需要2′-O-甲基转移酶的参与,该修饰可以降低RNA在体内引起的细胞先天免疫反应。

产品来源:
纯化自携带牛痘病毒mRNA帽结构2′ -O-甲基转移酶基因的E.coli菌株。

单位定义
1单位是指在37℃的条件下,1小时内将10pmol 80nt的带帽RNA转录子甲基化所需酶量。

产品组成:
组分规格
Cap0-mRNA 2′-O-Methyltransferase(50U/μL)50μL
10×Capping Buffer100μL
SAM(32mM)10μL
RNase-Free Water1mL

保存:-20℃,避免反复冻融。

反应条件
1×Capping Buffer,在37℃孵育。

缓冲体系:
1×Capping Buffer:
50mM Tris-HCl(pH8.0),5mM KCl,1mM MgCl2,1mM DTT。

质量控制:
无大肠杆菌DNA残留、无核酸内、外切酶残留及RNA酶残留。

注意事项:
1.SAM:需事先计算好SAM的用量,在反应开始前把分装的32mM的储备液稀释成2mM的工作液。SAM在pH7~8,37℃条件下不稳定,需要在反应开始之前新鲜配置。为避免SAM降解,该工作液需要保存于冰上。
2.Cap 0-RNA的制备:IVT RNA需进行纯化并溶解于RNase-free水中,不能将RNA溶解在EDTA溶液或其他盐溶液中。Cap 0-RNA可通过百奥莱博的mRNA加帽试剂盒(Cap0结构,货号:JN3055)反应体系获得。为减少反应步骤,也可通过在同一体系内添加两种酶直接获得Cap1-RNA,该反应基于百奥莱博的mRNA加帽试剂盒(Cap1结构,货号:JN3056),试剂盒内涵盖了Cap0结构加帽系统和2'-O-甲基转移酶。
3.RNA二级结构:一些RNA转录本可能形成稳定的二级结构(同源二聚体和发卡结构),如二级结构发生在转录本的5'端会影响加帽效率。在与加帽酶反应之前加热RNA可以去除转录产物5′端的二级结构,如果转录产物的5′端结构复杂,可以把加热时间延长至10min。
4.Poly(A)尾:如果加帽的RNA需要添加3'-poly(A)尾巴,可以使用白鸟莱博的E.coli Poly(A) Polymerase(货号:JN3052)进行加尾。加帽和加尾后的RNA需在进行RNA转染实验前做纯化处理。
5.RNase Inhibitor:在配置反应体系时,可以加入0.5μL百奥莱博的RNase抑制剂(货号:JN0013),同时去掉等体积的RNasefree水。


使用方法:
本步骤适用于10μg以内Cap 0-RNA(≥100nt)的Cap1反应,且可根据实验需要放大。
1.用RNase-free water将适量Capped RNA稀释至16μL;
2.将RNA置于65℃加热5min,结束后冰上放置5min;
3.将32mM SAM稀释至4mM;
4.依次加入以下各组分:
成分用量
Denatured Capped RNA16μL
10×Capping Buffer2μL
SAM(4mM)1μL
Cap0-mRNA 2′-O-Methyltransferase(50U/μL)1μL

5.37℃反应60min(对于长度小于200nt的RNA,将孵育时间延长至2小时)。
6.此时获得的Cap 1-RNA可直接进行3’端Poly(A)尾的添加,此反应可通过百奥莱博的E.coli Poly(A) Polymerase(货号:货号:JN3052)完成。


问题分析:
1.加帽效率低有哪些原因及解决方法?
a.在加帽反应之前,应将IVT产生的RNA纯化去除残留蛋白质,污染物和未结合核苷酸,并溶解在RNase-free水中,不能将RNA溶解在EDTA或其他盐溶液中;
b.SAM在室温下会慢慢降解,需始终放置在冰上,由于SAM的降解导致的N7甲基化效率低,会进一步导致加帽失败;
c.可以适当增加RNA热变性的条件,把加热时间延长至10min,加帽反应时间可延长至60min;
d.某些RNA会在5'末端形成稳定结构(如同源二聚体,发卡结构),限制加帽酶靠近。分析序列后可以将RNA变性温度增加。如5'末端高度结构化,需要通过分子生物学技术来修改序列。通常可以通过在转录RNA(非编码区)的DNA模板前5个碱基中进行单点突变来实现。
2.缓冲液出现白色沉淀如何解决?
a.将反应缓冲液在37℃孵育5min,彻底混匀以溶解沉淀物;
b.不要将试剂盒储存于-70℃。