酵母细胞壁结构复杂,用一般的裂解液很难破壁。使用Trizol等试剂提取酵母RNA,也只能获得5s rRNA。本试剂盒采用蜗牛酶与裂解液(Buffer Rlysis-Y)共同作用,10分钟有效破碎酵母细胞壁。不会造成机械破壁中的RNA损伤,确保RNA的完整性。再通过Buffer YCA纯化、乙醇沉淀等步骤,可获得高浓度的RNA。
从1mL过夜培养的酵母菌液中可获得10~20μg总RNA。获得的RNA OD260/OD280比值一般为2.0左右,可直接用于RT-PCR、Northern Blot、斑点杂交等实验
1.取1mL过夜培养的酵母菌液,加入1.5mL RNase-free离心管中,室温10000rpm离心1min,彻底弃掉培养基,收集菌体。
·1mL过夜培养的酵母培养物离心收集,湿重约为20mg。
·收集菌体后可用500μL DEPC-treated ddH2O漂洗一次,10000rpm离心1分钟,弃上清,进一步去除残留的培养基。
2.按每20mg菌体湿重取600μL Snailase Reaction Buffer加入步骤1中的离心管,同时加入50μL实验前准备好的Snailase,混匀,37℃水浴5min。4℃ 10000rpm离心2min,弃上清。
3.立即加入400μL Buffer Rlysis-Y震荡混匀,65℃水浴5min。
4.将离心管取出,冰浴5min后加入200μL Buffer YCA,混匀,12000rpm 4℃离心5min,取上清。
5.(可选)向上清液中加入等体积酚:氯仿(体积比为25:24,pH4.5),混匀。12000rpm 4℃离心5min,取上清液。
·此步骤可提高RNA的纯度和得率。
6.向上清液中加入等体积氯仿,混匀。12000rpm 4℃离心5min,取上清液。
7.加入上清液1/3体积的无水乙醇,混匀,室温放置3min,12000rpm离心5min,小心倒掉上清。
·加入无水乙醇混匀后,-20℃放置5~10分钟可提高RNA的得率。
8.用700μL的75%乙醇(请用DEPC-treated ddH2O配制)洗涤沉淀,12000rpm 4℃离心3min,小心倒掉上清。
9.重复步骤8一次。
10.室温倒置10min,尽可能使离心管中残留的乙醇彻底挥发。加入50μL的DEPC-treated ddH2O溶解沉淀,立即使用或-70℃长期保存。
·如果残留的乙醇有挂壁现象,倒掉液体后再短暂离心,将残液用移液器吸出。然后开盖室温放置5~10分钟至残留的乙醇完全挥发。
·吸取残液时注意不要将RNA沉淀取出,避免RNA损失。