试剂盒内容:
| 名称 | 50T | 100T | 温度 |
| 溶菌酶 | 3ml | 5.5ml | -20℃ |
| RNase A | 1m1 | 1m1×2 | -20℃ |
| 蛋白酶 K | 1ml | 1m1×2 | -20℃ |
| 溶液 A | 10ml | 20ml | RT |
| 溶液 B | 10ml | 20ml | RT |
| 漂洗液 | 15m1 | 15ml×2 | RT |
| 洗脱液 | 15m1 | 30m1 | RT |
| 吸附柱 | 50个 | 100个 | RT |
| 收集管 | 50个 | 100个 | RT |
| 说明书 | 1份 | 1份 | |
产品简介:
本试剂盒采用可以特异性结合DNA 的离心吸附柱和独特的缓冲液系统,提取革兰氏阳性菌基因组DNA。离心吸附柱中采用的硅基质材料为本公司特有新型材料,能够高效专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。提取的基因组DNA 片段大,纯度高,质量稳定可靠。使用本试剂盒提取的基因组DNA 可用于各种常规操作,包括酶切、PCR、文库构建、Southern 杂交等实验。
操作步骤(仅供参考):
使用前请先在漂洗液中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶体上的标签。所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
- 取细菌培养液1ml,12000rpm 离心1min.,尽量吸除上清。
- 向菌体中加入200ul 终浓度为20mg/ml 的溶菌酶,用溶菌酶干粉加入缓冲液20 mM Tris, pH 8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2% Triton X-100,37 ℃处理30 min 以上。(如果需要去除RNA,可加入20ul RNase A(100 mg/ml)溶液)
- (可选作,如做第3 步操作,可以将第2 步离心后的沉淀用于后续实验)向菌体中加入200ul 溶液A,振荡或用移液器吹打使菌体充分悬浮,向悬浮液中加入20ul 的RNase A (10mg/ml)和50ul 溶菌酶,充分颠倒混匀,室温放置30min-60min。
- 向管中加入20ul 的蛋白酶K (10mg/ml),充分混匀,55℃消化30-60min,消化期间可颠倒离心管混匀数次,直至样品消化完全为止,此时可见菌液呈清亮粘稠状。
- 向管中加入200ul 溶液B,充分颠倒混匀,如出现白色沉淀,可于75℃放置15-30min,沉淀即会消失,不影响后续实验。如果溶液未变清亮,说明样品消化不彻底,可能会导致DNA 的提取量以及纯度降低,还可能堵塞吸附柱。
- 向管中加入200ul 无水乙醇,充分混匀,此时还可能会出现絮状沉淀,不影响DNA 的提取,可将溶液和絮状沉淀都加入到吸附柱中,静置2min。
- 12000rpm 离心2min. 弃废液,将吸附柱放入收集管中。
- 向吸附柱中加入600ul 漂洗液(使用前请先检查是否己加入无水乙醇)。12000rpm 离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
- 向吸附柱中加入600ul 漂洗液,12000rpm 离心l min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
- 12000rpm 离心2min,将吸附柱敞口置于室温或50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续实验如酶切、PCR 等。
- 将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加50-200ul 经65℃水浴预热的洗脱液,室温放置5min,12000rpm 离心1min。
- 离心所得洗脱液再加入吸附柱中,室温放置2min,12000rpm 离心2 min,即可得到高质量的细菌基因组DNA。
注意事项:
- 样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA 片段较小且提取量下降。
- 若试剂盒中的溶液出现沉淀,可在65℃水浴中重新溶解后再使用,不影响提取效果。
- 如果实验中的离心步骤出现柱子堵塞的情况,可适当延长离心时间。
- 洗脱缓冲液的体积最好不少于50ul,体积过小会影响回收效率;洗脱液的pH 值对洗脱效率也有影响,若需要用水做洗脱液应保证其pH 值在8.0 左右(可用NaOH 将水的pH 值调至此范围), pH 值低于7. 0 会降低洗脱效率。DNA 产物应保存在-20℃,以防DNA 降解。
- DNA 浓度及纯度检测:得到的基因组DNA 片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。回收得到的DNA 片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。DNA 应在OD260 处有显著吸收峰,OD260 值为1.0 相当于大约50μg/ml 双链DNA、40μg/ml 单链DNA。OD260/0D280 比值应为1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水,比值会偏低,因为pH 值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。
- 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。