检测 SNPs 的方法很多，归纳起来可分为杂交法、熔解法、电泳法、测序法、化学法、酶学法、物理法以及它们的组合方法。而TaqMan探针和HRM是常用的两种方法：TaqMan SNP基因分型方法采用TaqMan探针和3’端结合MGB技术进行等位基因的区分。PCR反应过程通过对应于两个等位基因的两个TaqMan-MGB探针在同一个试管中进行，反应终止时测定所产生的荧光。TaqMan探针SNP分型方法适合对大样本量和少数SNP位点的检测需求。 除SNP检测，TaqMan探针还适用于多核苷酸多态性（MNP）检测及插入/缺失（indels）检测。TaqMan SNP基因分型原理：利用核酸外切酶对5’特异等位基因染色标记的切除产生持续的检验信号，反应体系包括：以基因组DNA 或PCR产物为模板；一对PCR引物, 以及分别用FAM和VIC标记的2条MGB探针检测SNP的两种类型。在PCR反应终点读取分型数据。
