3-磷酸甘油酯酶（Glycerol 3-phosphatase GPP，EC3.1.3.21）是催化甘油发酵的最后一步反应的酶，它将3-磷酸甘油的磷酸基脱掉后形成甘油，因此此酶的活力直接影响到甘油产量的大小。

3-磷酸甘油酯酶催化3-磷酸甘油生成甘油和磷酸根，钼蓝与磷酸根生成660nm处有特征吸收峰的物质，通过钼酸铵定磷法测定无机磷的增加量来计算3-磷酸甘油酯酶的活性。