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NLRP4 - NLR family pyrin domain containing 4 Gene

中文名称:含 NLR 家族 pyrin 结构域 4

种属: Homo sapiens

同用名: CT58; PAN2; RNH2; NALP4; PYPAF4; CLR19.5

基因 ID: 147945 | 基因类型: protein coding

关于 NLRP4

Cytogenetic location: 19q13.43 Genomic coordinates (GRCh38): 19:55,836,540-55,881,855 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 72 orthologues and 20 paralogues. Biased expression in testis (RPKM 3.5), lymph node (RPKM 0.8) and 1 other tissue.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是核苷酸结合和富含亮氨酸重复受体 (NLR) 家族的成员,预计含有一个 N 端热蛋白效应结构域 (PYD) ,一个位于中心的核苷酸结合和寡聚化结构域结构域 (NACHT) 和 C 端富含亮氨酸的重复序列 (LRR) 。由于蛋白质与其 NACHT 结构域的相互作用,该基因产物具有作为自噬和 I 型干扰素信号通路负调节剂的作用。 PYD 结构域也被证明在抑制 NF-kB (活化 B 细胞的核因子 kappa-轻链增强子) 中很重要。[RefSeq 提供,2016 年 12 月]

The protein encoded by this gene is a member of the nucleotide-binding and leucine-rich repeat receptor (NLR) family, and is predicted to contain an N-terminal pyrin effector domain (PYD), a centrally-located nucleotide-binding and oligomerization domain (NACHT) and C-terminal leucine-rich repeats (LRR). This gene product has a demonstrated role as a negative regulator of Autophagy and type I interferon signaling pathways as a result of protein interactions with its NACHT domain. The PYD domain has also been shown to be important in the inhibition of NF-kB (nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells). [provided by RefSeq, Dec 2016]

NLRP4 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_134444.5 NP_604393.2 NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables molecular adaptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of innate immune response IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

NLRP4 蛋白结构

PYRIN

PYRIN: PAAD/DAPIN/Pyrin domain (8 - 89)

NACHT

NACHT: NACHT domain (149 - 317)

LRR_6

LRR_6: Leucine Rich repeat (806 - 829)

LRR_6

LRR_6: Leucine Rich repeat (863 - 885)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 994 a.a.
蛋白主名 其他名称

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4

NACHT, leucine rich repeat and PYD containing 4

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus NLRP4 RGD RGD:1563529
Macaca mulatta NLRP4 VGNC VGNC:75233
Others NLRP4 NCBI