磷酸氢钙急性毒性LD50（大鼠经口）4000 mg/kg，LD50（兔经皮）>4720mg/kg，为实际低毒物质。长期吸入刺激口、鼻、喉和肺，导致味觉、嗅觉衰减，鼻孔出血。工作时应注意保护呼吸器官及皮肤，穿戴防尘面具、手套、工作服，以防吸人粉尘。
