母系统表达的蛋白一般都具有活性,所以都采用较温和的纯化方式来纯化目的蛋白,分泌型表达的蛋白有利于纯化,可用硫酸铵来自沉淀,然后用离子交换,凝胶过滤层析,疏水层析等方法进一步纯化。具体的方法和操作应按所处理的目的蛋白的性质选择。