液体菌种和固体菌种的优缺点可从以下几方面比较：
（1）生产周期
液体菌种具有生产周期短、菌丝来自生长快的优势，一般经振动或通360问答气培养3～7天即可培养货素蛋的好菌种。而固体种需20～30天时间菌丝才能长满瓶。
（2）菌龄
液体菌种菌龄均一，而固体菌种上下菌龄不一致，上部的菌丝菌龄大，易老化。所以在用于栽培时，液体种发菌快，出菇整齐。
（3）菌种保存期
液体菌种如静什假鲜背慢要认施苗但置保存，因菌丝在液体中透气性适来海军叫硫求谁报视苏差，菌丝因缺氧而易云着且控读对业指沙知扬衰老，活力下降，从而保存期比固体种要大大缩短。
（4）制种污染率
液体种在制作中由于液体培养基营养丰富，故极易污染杂菌，污染发生率要高于固体种制作。
（5）运输
液体种因培养基营养丰富，加之是液态，所以运输条件相当严格，稍有不慎即会造成菌种污染，不如固体菌种运输方便。
（6）菌种质量的检查
液体菌种质量的检查要难于固体种，不仅需要一定的技术技能，还需要一定的检测设备，一般生产者不易掌握。
生产者在使用液体菌种栽培时应注意，须采用与之相配套的栽培方法和栽培技术，才能最大限度地发挥液体菌种的优势。
