关于设计引物
需要在引物中引入酶切位点,想用Xba1和Kpn1,想问下保护碱基怎么加??阅读框怎样能不改变,另外,还用考虑发卡结构什么的吗?请问除此之外,还有没有其他的方法可以更方便的方法引入酶切位点?
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回答者:网友
酶切位点的保护碱基基本是大家常用以及默认的。Kpn1为:GGGTACCC 、GGGGTACCCC、CGGGGTACCCCG 三个,长度你可以根据你的引物来选择。Xba1为:CTCTAGAG 、G来自CTCTAGAGC 、TGCTCTAGAGCA 、CTAGTCTAGACTAG。具体要你自己来选择哪一个。比如退火温度,GC比值等等。保护碱基资料上都有,常见的酶切位点都有360问答保护碱基。设计引物你可以用primer5和Oligo6软件来设计,参数全部都能算出来,包括发夹结构。你也可以定点突变来引入你的酶切位点,但是也很麻烦。其他的方法还有甲基化筛选等等,我就不是很熟悉了。