去百度文库,查看完整内容>
内容来自用户:司绿baobo412
利
用系统进化分析软件对序列进行同源性分析
1.0目的
1
360问答.1为了保持国际上各个
耐药性实验室的高检验水准,进行分子进化分析是有很重要作用的。它不仅可以保证流行病学
回术商孩项目的顺利实现,而且有利于发现检测阶段可能产生的潜在的交叉污染。
1.2利用此软件进
陈调慢伯次良语大配不行分析所得的信息对于进行艾滋病毒在人群中传播的流行病学研究具有十分重要的意义。
1.3通过对实验室之前分析的数据与当前数
否与每尔歌服刘损聚还思据进行比较,可以发
包远新让现在此前实验过程中由于标本处理不当所导致的潜在的实验室污染。
1.4对于确保得到高质量的实验结果并及
到术盾并扬时发现可能出现在实验室
里的问题具有重要意义。2.0仪器设备
2.1计算机一台。
2.2W
indows 95以上的操作系统。
2.3BioEd
it以及MEGA 4分析软件。
2.3.1均为免费软件,可以从互联网上下载,
举治毫记副伯在计算机上进行安装。
3.0操作过程
3.1局限及要求
3.1.1经过序列编辑软件拼接处理后的txt文件或fa
sta文件均可,例如ChromasPro软件。
3
.1.2可以在MEGA上分析的分子序列或距离矩阵
部守击作数据。
3.1.3Mega 4软件只能将长度相
等的序列转换为MEGA输出文件,因此,任何
多序列文件必须通过BioEdit软件进行对齐修剪,然后才能进入通过
世谓普除伟续顾念找技Mega软件转换成*.meg格式进行分析。
3.1.4该数据集的大小受限于计算机上可用的物理(RAM
)和虚拟内存。3.1.123.3.3.53.3.8.3