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一. Overview Swiss-Pdb Viewer 又叫 Deep View. 它的功能如下: a.显示和分析生物大分子(protein)的结构与图解; b.给予一段氨基酸序列,从头建立蛋白质结构模型 c.找出并显示蛋白质中、蛋白质间、基团间的氢键 d.通过检晶仪检测电子密度图,判断电子密度图谱和模型的质量,从而可以确 定蛋白质模型中许多普通类型的缺陷; e.同时显示分析多个蛋白质的 3D 结构和序列; f.计算氨基酸残基的静电力和分子表面携带的最小自由能。 g.对序列已知结构未知的蛋白质,Deep View 会将氨基酸序列递交给 ExPASY , 通过找到同源序列进行比对,将比对结果通过 ExPASY 递交给 Swiss Model,做出同源模型。
详细参考:http://wenku.baidu.com/link?url=ycMWI1Hs7x3AvPc37CQdd8NA-vXRJj9YjmWdWv9twP3BMsgZIjJSl-NhEBVxNfmNRtRRigJREuAM2OYhyqoCBHgpTJRr_OdVpX27niSD0eq