一、基因型不同：
1、DH5a来自：
DH5a的基因型为：F-，φ80dlacZΔM15，Δ(lacZYA-argF)U169，deoR，recA1，endA1，hsdR17(rk-，mk+)，phoA，supE44，λ-，thi-1，gyrA96，relA1。
2、BL21：
BL21的基因型为F-，ompT，hsdS（rBB-mB克黑就优－），gal，dcm（DE3）。
二、特性不同：
1、D360问答H5a：
DH5a是一种常用于质粒克隆的菌株。E.coliDH5a在使用pUC系列质粒载体转化时，可与载体编码的β－半乳糖苷酶氨基端实现α－互补。
2、BL21：
该菌株用于高效表达克隆于含有噬菌体T7启动子的表达载体（如pET系列）的基因。T7噬菌体RNA聚合酶位于λ噬菌体DE3区，该而孙空基从大买地兵仍区整合于BL21的染色体上。
菌株作用
BL21(DE3)菌株用于高效表达克隆于含有噬菌体T7启动子的表达载体(如pET系列)的基因。λ噬菌体DE3区含有T7噬菌体RNA聚合酶，该区整合于BL21的染色体上，所以称为BL21(DE3)。
可同时表达T7 RNA聚合酶和大肠杆枣激菌RNA聚合酶，用于pET系列，pGEX，pMAL等质粒的蛋白表达。BL21(DE3)感受态细胞由特殊工艺制作，pUC19质粒检测转化效率达107cfu/μg DNA。
以上内容参坦岩漏考：百度百科-大肠让烂杆菌菌株
