524-14-1 (Malonyl CoA,Coenzyme A, S-(hydrogen propanedioate))

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结构式：

Malonyl CoAMOL文件

CAS号：

524-14-1

中文名称：

Malonyl CoA

英文名称：

Coenzyme A, S-(hydrogen propanedioate)

分子式：

C₂₄H₃₈N₇O₁₉P₃S

分子量：

853.580307483673

Malonyl CoA(524-14-1)名称与标识符

名称

中文别名：

丙二酰辅酶A-钠盐;丙二酰辅酶A钠盐;

英文别名：

S-(hydrogen malonyl)coenzyme A;Malonyl coenzyme A;Coenzyme A, S-(hydrogen propanedioate);1-[5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-10,14,19-trioxo-2,4,6-trioxa-18-thia-11,15-diaza-3,5-diphosphahenicosan-21-oic acid 3,5-dioxide (non-preferred name);(3S,5R,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-10,14,19-trioxo-2,4,6-trioxa-18-thia-11,15-diaza-3,5-diphosphahenicosan-21-oic acid 3,5-dioxide (non-preferred name);(3S,5R,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-; Thiomalonic acid S-ester with coenzyme A; S-Malonyl-CoA; Malonyl coenzyme A; Malonyl CoA;Coenzyme A, S-(hydrogen malonate) (6CI,8CI);BDBM50260111;S-(hydrogen propanedioic acid;3-[(2-{3-[(2R)-3-[({[({[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl)oxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)methyl]-2-hydroxy-3-methylbutanamido]propanamido}ethyl)sulfanyl]-3-oxopropanoic acid;SCHEMBL6450;Q51589793;HY-115899;omega-Carboxyacyl-Coenzyme A;CHEBI:15531;GTPL5219;Malonyl CoA;C03188;Thiomalonic acid S-ester with coenzyme A;C24H38N7O19P3S;S-Malonyl-CoA;S-(hydrogen propanedioate) Coenzyme A;omega-Carboxyacyl-CoA;D0D0PV;LNB9YCJ9F9;S-(hydrogen propanedioate;DTXSID40904351;Coenzyme A, S-(hydrogen malonate);524-14-1;CS-0379299;DB04524;C24-H38-N7-O19-P3-S;LMFA07050345;CHEMBL1234355;J-002124;3'-phosphoadenosine 5'-{3-[(3R)-4-{[3-({2-[(3-carboxyacetyl)sulfanyl]ethyl}amino)-3-oxopropyl]amino}-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4-oxobutyl] dihydrogen diphosphate};S-(hydrogen propanedioate) CoA;9H-purin-6-amine,9-[5-O-[[[[[(3R)-4-[[3-[[2-[(carboxyacetyl)thio]ethyl]amino]-3-oxopropyl]amino]-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4-oxobutyl]oxy]hydroxyphosphinyl]oxy]hydroxyphosphinyl]-3-O-phosphono-beta-D-rib;malonyl-CoA;3-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethylsulfanyl]-3-oxopropanoic acid;malonyl-coenzyme a;C00083;(2S)-Malonyl-CoA;MeSH ID: D008316;NS00015050;CoA, Malonyl;Malonyl coenzyme A lithium salt;

标识符

InChIKey：

LTYOQGRJFJAKNA-DVVLENMVSA-N

Inchi：

1S/C24H38N7O19P3S/c1-24(2,19(37)22(38)27-4-3-13(32)26-5-6-54-15(35)7-14(33)34)9-47-53(44,45)50-52(42,43)46-8-12-18(49-51(39,40)41)17(36)23(48-12)31-11-30-16-20(25)28-10-29-21(16)31/h10-12,17-19,23,36-37H,3-9H2,1-2H3,(H,26,32)(H,27,38)(H,33,34)(H,42,43)(H,44,45)(H2,25,28,29)(H2,39,40,41)/t12-,17-,18-,19+,23-/m1/s1

SMILES：

S(C(CC(=O)O)=O)CCNC(CCNC([C@@H](C(C)(C)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@H](N2C=NC3C(N)=NC=NC2=3)O1)O)OP(=O)(O)O)O)=O)=O

Malonyl CoA(524-14-1)物化性质

实验特性

LogP : -0.49760
PSA : 455.66000
折射率 : 1.729
密度 : 1.955

计算特性

精确分子量 : 853.115602
氢键供体数量 : 10
氢键受体数量 : 20
可旋转化学键数量 : 22
同位素质量 : 853.115602
重原子数量 : 54
复杂度 : 1490
同位素原子数量 : 0
确定原子立构中心数量 : 5
不确定原子立构中心数量 : 0
确定化学键立构中心数量 : 0
不确定化学键立构中心数量 : 0
共价键单元数量 : 1
疏水参数计算参考值（XlogP） : _5.9
拓扑分子极性表面积 : 426

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Malonyl CoA(524-14-1)合成路线

合成路线：1 步

141-95-7

85-61-0

524-14-1

反应条件：

1.1R:R:MgCl2, S:H2O, 30 min, 30°C

参考文献：

One-Pot Enzymatic Total Synthesis of Presteffimycinone, an Early Intermediate of the Anthracycline Antibiotic Steffimycin Biosynthesis

By Wang, Guojun et al, Organic Letters, 2017, 19(3), 540-543

合成路线：1 步

85-61-0

141-82-2

524-14-1

反应条件：

1.1R:R:MgCl2, C:9033-20-9, S:H2O, overnight, 30°C, pH 7.4

参考文献：

Biocatalytic Total Synthesis of Ikarugamycin

By Greunke, Christian et al, Angewandte Chemie, 2017, 56(15), 4351-4355

合成路线：1 步

反应条件：

1.1

参考文献：

Rational Control of Polyketide Extender Units by Structure-Based Engineering of a Crotonyl-CoA Carboxylase/Reductase in Antimycin Biosynthesis

By Zhang, Lihan et al, Angewandte Chemie, 2015, 54(45), 13462-13465

合成路线：1 步

85-61-0

141-82-2

524-14-1

反应条件：

1.1R:MgCl2, R:R:NaH2PO4, 3 h, 25°C, pH 7
1.2R:MeOH, cooled

参考文献：

Evaluating nonpolar surface area and liquid chromatography/mass spectrometry response: an application for site occupancy measurements for enzyme intermediates in polyketide biosynthesis

By Randall, Shan M. et al, Rapid Communications in Mass Spectrometry, 2014, 28(23), 2511-2522

合成路线：2 步

反应条件：

1.1S:PhMe, 4 h, 140°C
2.1R:NaHCO3, S:H2O, 10 min, 0°C
2.2R:NaHCO3, S:H2O, S:Me2CO, 0°C, pH 8.0; 12 h, 0°C
2.3R:HCl, S:H2O, pH 6.0

参考文献：

Rapid preparation of (methyl)malonyl coenzyme A and enzymatic formation of unusual polyketides by type III polyketide synthase from Aquilaria sinensis

By Gao, Bo-Wen et al, Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2015, 25(6), 1279-1283

合成路线：1 步

141-82-2

85-61-0

_90%

524-14-1

反应条件：

1.1R:MgCl2, R:C:9033-20-9, S:H2O, overnight, 25°C, pH 7
1.2R:MeOH, cooled

参考文献：

Promiscuity of a modular polyketide synthase towards natural and non-natural extender units

By Koryakina, Irina et al, Organic & Biomolecular Chemistry, 2013, 11(27), 4449-4458

合成路线：1 步